آنالیز برخی از خصوصیات بیوانفورماتیکی ژن پروانسولین انسانی

انسولین هورمونی است که در تنظیم قند خون نقش داشته و کمبود آن باعث بیماری دیابت نوع 1 می گردد. هزینه های سالیانه جهانی دیابت در سال2025 به رقمی در حدود 300 میلیارد دلار می رسد. در این بررسی برخی از خصوصیات بیوانفورماتیکی این ژن با استفاده از اطلاعات پایگاه هایNCBI و Expasy مورد ارزیابی قرار گرفت. هورمون انسولین، پپتیدی با 15 اسید آمینه است که 5.8 KDa وزن دارد و از پیش ماده پروانسولین مشتق می شود. پروانسولین نیز در پانکراس ترشح می گردد و شامل 110 اسید آمینه است که از این میان ،42 اسید آمینه در نقش توالی سی گنالی بوده و68 اسید آمینهباقیمانده نیز عبارتند از B-chain (03 اسید آمینه)، C peptide (43 اسید آمینه) و A-chain (03 اسید آمینه). طی بیوسنتز انسولین در پانکراسC peptide بوسیله prohormone convertase های 2 و 3 به ترتیب در محل هایB-chain/C-peptide و C-peptide⁄A-chain شکسته می شود وانسولین 15 اسید آمینه ای با تشکیل یک پیوند دی سولفیدی بینA-chain و B-chain ایجاد می گردد. داده هایMap viewer نشان می دهدپروانسولین بر روی کروموزوم شماره 11 قرار دارد. از برنامه Smart برای تعیین دامین های پروانسولین استفاده شد و یک سیگنال پپتاید و نیز دامینIIGF در آن یافت گردید. همچنین برای تعیین ترکیب نوکلئوتیدهای این ژن از پایگاه Genomatix استفاده شده و مشخص گردید که در این ژن بیش از 31٪ از نوکلئوتیدها گوانین هستند، علاوه بر این با استفاده از Protoparm، ترکیب اسیدهای آمینه تعیین گردید به صورتی که فراوان ترین اسیدآمینه آن لوسین وگلایسین (به ترتیب 81 و 11 ٪) می باشند. نیز نقطه ایزوالکتریک آن 22/5 و نیمه عمر آن در سلول های پستانداران 03 ساعت محاسبه شد. همچنین بااستفاده از نرم افزار Mega 5.0 درخت فیلوژنتیکی برای بررسی روابط تکاملی ژن پروانسولین انسانی با سایر گونه های جانوری رسم گردیده و مشخص شدکه بیشترین نزدیکی با ژن متناظر در موش وجود دارد. همچنین آنالیز منطقه پروموتری با استفاده از پایگاه PLACE منجر به یافتن تعدادی از توالی هایتنظیمی چون GATABOX و ARR1AT گردید. برای رسم ساختارهای دو بعدی و سه بعدی پروتئین نیز به ترتیب ازPSIPRED و Swiss-Model استفاده شد. اطلاعات این بررسی می تواند در انتخاب ناقل ها و سیستم های کارآمد برای بیان هورمون انسولین مناسب باشد.

کلیدواژه ها:

بیوانفورماتیک ، پرو انسولین انسانی ، ساختار سه بعدی