ارزیابی روش جدید (آنالیز منحنی ذوب) تعیین ژنوتیپ چند شکلی های نوکلئوتیدی (SNP) و مقایسه آن با روش TaqMan RealTime PCR (مطالعه موردی: مقاومت ژنتیکی به بیماری اسکرایی در گوسفندان ایران)

به منظور ارزیابی روش جدید تع یین ژنوتیپ چندشکلی های تکنوکلئوتیدی ) SNP (، شناسایی مقاومت/حساسیت به بیماری اسکراپیگوسفند به عنوان کی مورد مناسب، که همزمان نیاز به بررسی و تع یینژنوتیپ همزمان سه SNP و تع یین هاپلوتیپ هر فرد در این سه جایگاهدارد، مطالعه شد. اسکراپی یک بیماری تحلیل برنده عصبی واگیر درگوسفند است که به تحلیل و تضعیف دایمی سیستم عصبی می انجامد.گرچه وجود پروتئین پریونی تغییر شکل یافته به عنوان عامل بیماریزابرای بروز بیماری نیاز است ولی میزان حساسیت به این بیماری به میزانزیادی تحت تاثیر ساختار ژنتیکی دامهاست. چندشکلی ژن PrP بویژه درسه کدون 136 ، 154 و 171 با وقوع اسکراپی مرتبط تشخیص داده شدهاست. نمونه ای از جمعیت گوسفند ایرانی شامل 120 فرد از 8 جمعیتبرای این سه کدون به دو روش PCR RealTime به کمک کاوشگرهایTaqMan و آنالیز منحنی ذوب تعیین ژنوتیپ شدند. نتایج حاصل ازهرکی از این دو روش کیسان بوده و کیدیگر را تا یید می نمایند. مقایسهدو روش بکار رفته در این مطالعه از حیث سرعت، دقت، تکرارپذیری وهزینه و تجهیزات مورد نیاز حاکی از برتری های محسوس روش تعیینژنوتیپ TaqMan RealTime PCR بر روش دیگر است به نحوی که میتوان آنرا در قالب یک کیت تشخیص مولکولی تجاری و برای هر تعدادSNP ارائه داد

کلیدواژه ها:

تعیین ژنوتیپ TaqMan RealTime PCR ، SNP ، آنالیز منحنی ذوب ، اسکرایی