بررسی فنوتیپی و ژنوتیپی انواع سدوموناس های هالوفیل و هالوتولرنت از دریاچه ارومیه

دریاچه شور ارومیه، بزرگترین دریاچه داخلی و دایمی کشور وبزرگترین آبگیر دائمی آسیای غربی است که در شمال غرب فلاتایران واقع شده است.این پژوهش، سعی در بررسی بخشی از تنوع زیستی باکتریایی دریاچهارومیه و ارائه ذخایر ژنت کیی جدید از منابع عظیم جمعیتهای م کیروبیدارد که خود پایه کاربردهای وسیعی در دانش بیوتکنولوژی است.دریاچه های نمک با شوری در حد فوق اشباع کیی از محیطهای اکستریممی باشند و دریاچه ارومیه بعنوان کی زیستگاه اکستریم، و ذخیره گاهژنی م کیروارگانیسم های نمکدوست به ویژه انواع سودوموناسهای هالوفیلو هالوتولرنت، دارای اهمیت مطالعاتی می باشد.نمونه های تهیه شده از دریاچه ارومیه، که در شرایط استریل به آزمایشگاهمنتقل شده بود، به منظور افزایش حضور باکتری، مورد سانتریفیوژ قرارگرفته و در محیط Halophilic Broth در دمای 30 درجه سانتیگراد درانکوباتور ش کیردار انکوبه شده و هر 24 ساعت مورد بررسی قرار گرفت.سپس از محیط فوق بر روی محیط های جامد مانند ،HM، MacConkeyمولرهیلتون، نوترینت آگار و SeaWaterAgar که همگی محتویدرصدهای مختلف نمک بودند منتقل شد. برای خالص سازی کشتهایمتوالی انجام گرفت.سپس کلنیها از نظر شکل، پیگمان، حرکت مورد بررسی قرار گرفته وتستهای بیوشیمیایی انجام شد.برای تکمیل مطالعه، پس از استخراج DNA ژنومی جدایه های منتخب،توسط پرایمرهای جهانشمول 27F , 1492R ، ژن 16SrRNA آنها تکثیرو تع یین توالی شد.نهایتا توسط نرم افزار Chromas Pro نتایج ویرایش شد، توالی هایسودوموناسهای مورد نظر با استفاده از نرم افزارهای موجود برای باز خوانیو مرتب کردن استفاده شد. سپس بوسیله BLAST با توالیهای ثبت شدهدر پایگاه اطلاعات ژنومی NCBI مقایسه شد. آنالیز های فیلوژنت کی سویههای بدست آمده با نرم افزار Mega4 و رسم درخت فیلوژنت کی به روشneighbour-joining صورت گرفت.این پژوهش در راستای ارائه ذخیره ژنت کیی از دریاچه ارومیه می تواند بهشناسایی گونه های مختلف سودوموناسهای نمکدوست در این اکوسیستمو کاربردهای بیوتکنولوژ کیی آنها منجر شود

کلیدواژه ها:

دریاچه ارومیه ، هالوفیل ، هالوتولرنت ، سودوموناس