بررسی تنوع زیستی قارچ های تجزیه کننده سلولز بر اساس مطالعه ژن سلولاز

تجزیه سلولز به عنوان گسترد هترین بیوپلیمر بر روی کره زمین از اهمیتخاصی برخوردار است. در طبیعت میکروارگانیز مهای زیادی در اینتجزیه دخی لاند. دلیل مطرح شدن قار چها بیش از میکروارگانیز مهایدیگر توانایی آ نها در تولید مقدار زیادی از انواع سلولازها و پرتوان تربودن این آنزی مها نسبت به آنزی مهای باکتریایی م یباشد. سلولاز بهصورت کمپلکسی از سه آنزیم اندوگلوکاناز، اگزوگلوکاناز و بتا گلوکوزیدازم یباشد که اگزوگلوکانازها از آنجایی که بخش اعظم کل پروتئین سلولاز) %70-40 ( را تشکیل داده و قادر به تجزیه کریستال سلولز به عنواننفوذناپذیرترین و مقاو مترین بخش از ساختار سلولز م یباشند، از بیشتریناهمیت برخورداراند.در این تحقیق سه جنس Alternaria، Chaetomium و Penicilliumکه قار چهای غالب جدا شده از کتب در حال تخریب موجود در کتابخانهملی بودند مورد مطالعه قرا گرفتند. ژنوم این قار چها با استفاده از تکینکCTAB استخراج شد. با هم تراز کردن توال یهای پروتئینی اگزوگلوکانازهایثبت شده در دیتابیس آنزی مهای مؤثر بر کربوهیدرات، نواحی حفاظتشده این آنزی مها شناسایی گردید. با بررسی توال یهای نوکلئوتیدی و بااستفاده از codon usage یک جفت پرایم دجنریت طراحی گردید کهبا استفاده از آ ن و با بکارگیری پروتک لهای خاصی برای هر جنس، ژناگزوگلوکاناز در هر سه جنس به صورت قطعه ای به طول 500-bp700تکثیر یافت. استخراج DNA از ژل و تعیین توالی نشان داد این سه آنزیممتعلق به گلیکوزیل هیدرولازهای خانواده 7 م یباشند. تنوع شگفت انگیزژن سلولاز نه تنها در بین جن سهای مختلف قارچی بلکه حتی مابینگونه های مختلف یک جنس م یتواند ابزار مفیدی برای بررسی تنوعجمعیت قارچی مورد استفاده قرار گیرد. تاکنون پرایمرهای دجنریت برایسلولازهای قارچی طراحی شده بودند اما توال یهای کوتا هتری از دومینکاتالیتیک را تکثیر کرده، فوق العاده دجنریت بوده و قدرت تمایز بینژ نهای اندوگلوکاناز و اگزوگلوکاناز را نداشتند.

کلیدواژه ها:

سلییوهیدرولاز ، قارچ ، تجزیه سلولز ، اگزوگلوکاناز ، سلولاز