آنالیز تصاویر الکتروفورز ژل دو بعدی از نمونه های بیولوژیکی
محل انتشار: شانزدهمین کنفرانس مهندسی پزشکی ایران
سال انتشار: 1388
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 6,398
فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICBME16_036
تاریخ نمایه سازی: 11 تیر 1388
چکیده مقاله:
الکتروفورز ژل دو بعدی موثرترین روش در تفکیک پروتئینها در نمونه های بیولوژیکی است که اساس علم پروتئوم را تشکیل می دهد. در این روش بعد از جداسازی پروتئینها در دو بعد، تصویر ژل آنها تهیه می شود. با مقایسه تصاویر ژل در دو نمونه سالم و نمونه بیمار یا تحت درمان می توان نشانگرهای حیاتی را در این نمونه ها یافت. این نشانگرها آشکار کننده تغییرات در بیان پروتئینی درنمونه های بیولوژیکی می باشند. تحلیل این تصاویر مستلزم سه مرحله ناحیه بندی، تطابق و آنالیز آماری می باشد. در این مقاله درمرحله ناحیه بندی ابتدا تصاویر با فیلتر لاپلاسین گوسین لبه یابی می شود. و سپس از الگوریتم حوضچه آبگیر با نشانگرهای کنترل شده برای ناحیه بندی استفاده می گردد. برای اصلاح ناحیه بندی و تفکیک نواحی مناسب از آرتیفکت ها ویژگیهای شکل از نواحی استخراج می گردند. در مرحله تطابق بایست نواحیی که در دو تصویر با هم مطابقت دارند مشخص گردند. جهت این امر نواحیی که مرکز آنها در فاصله اقلیدوسی مناسب از هم در دو شکل قرار گرفته اند به لحاظ ویژگیهای گوناگون با هم مقایسه می گردند و ماتریسهای اختلاف این ویژگیها در دو ناحیه محاسبه می شوند. دو ناحیه ای که در دو تصویر کمترین اختلاف ویژگیها را دارند به عنوان نواحی تطابق یافته انتخاب می شوند. در مرحله آنالیز آماری باید نواحی تطابق یافته در دو تصویر به لحاظ ویژگیهای آماری مقایسه گردند تا نواحیی که حذف یا اضافه شده اند و یا از لحاظ ساختار و فراوانی دچار تغییرات معنادار شده اند به عنوان نشانگرهای حیاتی آشکار گردند. جهت آنالیز آماری در این مقاله از تستهای تی و ویلکاکسون استفاده می گردد. تصاویری که در این مقاله بررسی می شوند تصاویری از ژلهای تهیه شده از رده سلولی BHK در دو نمونه سالم و نمونه آلوده به ویروس هاری می باشند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
پگاه شرف صالح
دانشگاه تربیت مدرس
محمدحسین میران بیگی
دانشگاه تربیت مدرس
بهروز وزیری
انستیتو پاستور ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :