ساختار آموزش بیان ژن با استفاده از معماری عمیق وشبکه عصبی کانولوشن عمیق بازگشتی و پیچشی هیبریدی برای تعیین کار زنجیره هایDNA

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 460

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ICTI01_087

تاریخ نمایه سازی: 11 مرداد 1396

چکیده مقاله:

ژنها نقش مرکزی در فرآیندهای زیستی را بازی میکنند. فناوری ریزآرایه DNA مطالعه بیان رفتار هزاران ژن را در یک سیر ممکن ساخته است. اغلب، داده بیان ژن بهمنظور تولید ویژگیهایی برای وظایف یادگیری نظارتشده و نشده، استفاده شده است.پیشرفتهایی در زمینه یادگیری عمیق در دسترس مجموعههای معماری ایجاد شدهاند. در این مقاله، ما از معماری عمیق از قبل آموزش دیده در شیوهای بدون نظارت با استفاده از خودرمزگذار حذف نویز بهعنوان یک گام پیشپردازش برای وظیفه یادگیری نظارتنشده استفاده میکنیم. خودرمزگذار حذف نویز برای یادگیری و تولید ویژگیهایی برای وظایف یادگیری نظارتشده بیشتر استفاده شود. مدلسازی خواص و کارهای زنجیره DNA کار مهم اما چالشی در حوزه وسیع ژنومیک است. این کار بخصوص برای DNA بدون کدگذاری مشکل است، که کار آن هنوز خوب درک نشده. یک مدل پیش بینی قوی برای کار DNA می تواند مزایای بزرگی برای تحقیقات علمی داشته باشد زیرا بیش از 98% ژنوم انسان بدون کد گذاری است و 93% گونه های وابسته به بیماری در این نواحی قرار دارند. برای رفع این نیازDanQ را پیشنهاد می کنیم، که یک چهارچوب شبکه عصبی بازگشتی حافظه کوتاه مدت دو جهتی و هیبریدی جدید برای پیش بینی کار عدم کدگذاری از ابتدا از زنجیر است.

نویسندگان

مریم حنیفه

دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی فناوری اطلاعات، دانشکده تعالی قم

رضا احسن

عضو هیات علمی، واحد قم، دانشگاه آزاد اسلامی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Friedman, Nir. 'Inferring cellular networks using probabilistic graphical models. 'Science ...
  • Gardner, T. S., Di Bernardo, D., Lorenz, D., & Collins, ...
  • Julius, Agung, Michael Zavlanos, Stephen Boyd, and George J. Pappas. ...
  • LeCun, Y., Bengio, Y. and Hinton, G. (2015) Deep learning. ...
  • Alipanahi, B., Delong, A., Weirau ch, M.T. and Frey, B.J. ...
  • Quang, D., Chen, Y. and Xie, X. (2015) DANN: a ...
  • Chen, Y., Li, Y., Narayan, R., Sub ramanian, A. and ...
  • Jiang, Daxin, Chun Tang, and Aidong Zhang. "Cluster analysis for ...
  • Hinton, Geoffrey E., Simon Osindero, and Yee-Whye Teh. _ fast ...
  • Wang, Haohan, and Bhiksha Raj. "A Survey: Time Travel in ...
  • Vincent, Pascal, Hugo Larochelle, Yoshua Bengio, and Pierre- Antoine Manzagol. ...
  • Vincent, Pascal, Hugo Larochelle, Isabelle Lajoie, Yoshua Bengio, and Pierre-A ...
  • Oba, Shigeyuki, Masa-aki Sato, Ichiro Takemasa, Morito Monden, Kenichi Matsubara, ...
  • H indorff, L.A., Seth upathy, P., Junkins , H.A., Ra ...
  • LeCun, Y., Bottou, L., Bengio, Y. and Haffner, P. (1998) ...
  • Zhou, J. and T royanskaya , O.G. (2015) Predicting effects ...
  • Graves, A. and Schmidhub er, J. (2005) Framewise phoneme classifica ...
  • Graves, A., Jaitly, N. and M ohamed, A.-R. (2013) Hybrid ...
  • Sunde rmeyer, M., Alkhouli, T., Wuebker, J. and Ney, H. ...
  • Zhu, W., Lan, C., Xing, J., Li, Y., Shen, L., ...
  • Quang, D. and Xie, X. (2014) EXTREME: an online EM ...
  • Quang, D.X., Erdos, M.R., Parker, S. C.J. and Collins, F.S. ...
  • ENCODE Project Consortium. (2012) An integrated encyclopedia of DNA elements ...
  • Gupta, S., Sta n a toyannopoul os, J.A., Nob le, ...
  • Medina -Rivera, A., Defrance, M., Sand, O., Herrmann, C . ...
  • Leslie, R., O 'Donnell, C.J. and J ohnson, A.D. (2014) ...
  • Welter, D., Ma cArthur, J., Morales, J., Burdett, T., Hall, ...
  • Genomes Project Consortium, Ab ecasis, G.R., Auton, A., B rooks, ...
  • نمایش کامل مراجع