خوشه‌بندی داده‌های بیان ژنی و کاربرد آن در تحلیل داده‌های سرطان پستان

به کارگیری تکنولوژی ریزسنجش DNA (ANA Microarray) در سال‌های اخیر موجب تولید حجم انبوهای از داده‌های بیان ژنی شده است. در سال‌های اخیر تحلیل آماری این داده‌ها مورد توجه پژوهشگران قرار گرفته است. در این مقاله داده‌های بیان ژنی سرطان پستان با استفاده از روش‌های آماری (خوشه بندی سلسله مراتبی و غیر سلسله مراتبی) خوشه‌بندی گردید. در هر دو روش خوشه‌بندی، داده‌ها به دو خوشه تقسیم شدند. روش‌های مختلف خوشه‌بندی با توجه با گروه‌بندی واقعی (BRCA1, BRCA2) مورد مقایسه قرار گرفتند. ویژگی روش خوشه‌بندی سلسله مراتبی در تشخیص افراد BRCA1، 94درصد و حساسیت آن 100 درصد بدست آمد، ویژگی روش خوشه‌بندی غیر سلسله مراتبی در تشخیص افراد BRCA1، 89 درصد و حساسیت آن 100 درصد بدست آمد که نشان دهنده عملکرد خوب دو روش خوشه‌بندی است.

کلیدواژه ها:

خوشه‌بندی ، ریزسنجش DNA ، بیان ژن ، سرطان پستان