تعیین توالی نوکلئوتیدی ژن aroA جدا شده از طیور مبتلا به کلی باسیلوز در ایران و مقایسه آن با سویه های موجود در بانک ژنی

ژن aroA یکی از ژن های مهم برای تولید اسید آمینه های آروماتیک می باشد وبرای حیات باکتری بسیار ضروری است. نشان داده شده است که توالی ژنی aroA در باکتری ها متفاوت است، بنابراین هدف این مطالعه تعیین توالی نوکلئوتیدی ژن aroA در سویه اشریشیاکلی بومی O78:K80 برای مشخص کردن تفاوت ها بین این سویه و سویه های موجود در بانک ژنی اشریشیاکلی O78:K80 بود. برای ازدیاد زن oroA در سویه بومی از واکنش زنجیره ای پلیمراز استفاده شد. محصول 1206 بازی واکنش زنجیره ای پلیمراز از ژل الکتروفورز استخراج و در پلاسمید pTZ57R همسان سازی شدو سپس توالی نوکلئوتیدی آن تعیین گردید. این توالی هم از نظر توالی نوکلئوتیدی و هم از نظر توالی اسید آمینه ای با سویه های موجود در بانک ژنی مقایسه شد. نتایج نشان داد که توالی در ژن aroA اشریشیاکلی بومی با سویه های اشریشیاکلی موجود در بانک ژنی از لحاظ 2 اسید آمینه تفاوت دارد، که به ترتیب عبارتند از اسیدآمینه سی و نهم سویه های موجود در بانک ژنی که ترنونین (Threonine) است و به جای آن در سویه بومی ایزولوسین (Isoleucine) قرار گرفته و دیگری اسید آمینه دویست و چهلم که به جای اسید گلوتامیک (glutamic acid) در سویه های موجود در بانک ژنی، گلیسین (Glycine) در سویه بومی نشسته است. دانستن این تفاوت ها برای انجام روش های مولکولی، طراحی آغازگرهای مختلف و تحقیقات بعدی مهم است.

کلیدواژه ها:

اشریشیاکلی ، ژن aroA ، رمزگشایی ، ایران