شناسایی و بررسی خصوصیات چند شکلی تک نوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر ژن اینترلوکین-8 در گاوهای بومی و هلشتاین ایران

زمینه مطالعه: اینترلوکین -8، سیتوکین پیش التهابی، پروتیین کوچکی است که نقش آن جذب و فعال کردن نوتروفیل ها در مراحل اولیه دفاع میزبان در مقابل هجوم باکتری ها است. چند شکلی تک نوکلئوتیدی در نحیه پروموتروزن اینترلوکین -8 می تواند با تأثیر بر فرآیند رونویسی این ژن، نقش و فعالیت آن را تحت تأثیر قرار دهد. هدف: شناسایی و بررسی چند شکلی های تک نوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر این ژن در گاوهای بومی و هلشتاین بوده است. روش کار: بخشی از ناحیه پرومورترژن اینترلوکین -8 توسط تکنیک تفاوت فرم فضایی رشته های منفرد (SSCP) در گاوهای دو نزاد تعیین ژنوتیپ شد. سپس هر الگوی مشاهده شده تعیین توالی شد و همترازی بین توالی ها جهت شناسایی چندشکلی های تک نوکلئوتیدی صورت گرفت. همچنین، تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی جهت بررسی ارتباط چند شکلی های تک نوکلئوتیدی بر راندمان اتصال فاکتورهای رونویسی در ناحیه تکثیر شده صورت گرفت. نتایج: در این مطالعه، در که نمونه های بررسی شده تعداد 4 الگوی (SSCPs) مجزا مشاهده شد که با تعیین توالی نوکلئوتیدی آنها تعداد 2 چند شکلی تک نوکلئوتیدی درجایگاه های 126- و 180- قبل از شروع رونویسی آسکار شد که چند شکلی تک نوکلئوتیدی جایگاه 126- تنها در گاوهای بومی مشاهده شد. بررسی بیوانفورماتیکی چند شکلی های شناسایی شده روی جایگاه فاکتورهای رونویسی نشان داد که جایگزینی نوکلئوتیدها در جایگاه های 126- و 180- به ترتیب منجر به ایجاد جایگاه اتصال برای فاکتورهای رونویسی Ik-2 و oct-1 شد. نتیجه گیری نهایی: امکان نقش کاربرد چندشکلی های شناسایی شده در فعالیت این ژن به اثبات برسد. مطالعات بیشتری جهت ارزیابی چندشکلی های شناسایی شده بر روی صفات مقاومت به بیماری در گاو مورد نیاز می باشد.

کلیدواژه ها:

اینترلوکین -8 ، چندشکلی تک نوکلئوتیدی ، پروموتر ، SSCP ، فاکتورهای رونویسی