بررسی خصوصیات فوتیپی و ژنوتیپی جدایه های Acidovorax avenae subsp .avenae عامل نواری باکتریایی برنج در استان مازندران

برنج بعد از گندم مهمترین محصول زراعی و غذای بیش از نیمی از مردم جهان می باشد. یکی از عوامل محدود کننده کشت و تولید برنج بیماری های باکتریایی هستند. عامل بیماری نوار قهوه ای در گیاهچه های برنج Acidovorax avenae subsp. Avenae می باشد که انتشار جهانی داشته و در اکثر برنجکاری های دنیا وجود دارد به منظور شناسایی دقیق عامل بیماری و بررسی تنوع فنوتیپی و ژنوتیپی باکتری ها در سال زراعی 92 از خزانه های برنج دارای علائم بیماری چندین شهر از استان مازندران نمونه برداری به عمل آمد. نمونه ها پس از کشت بر روی محیط افتراقی SNR و انجام آزمون های بیوشیمیایی شناسایی شدند . به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه ها، DNA ژنومی استخراج و در واکنش زنجیره ای پلیمراز با روش BOX-PCR به کار برده شد. محصول تکثیر شده در ژل آگارز 1/2 درصد الکتروفورز و با اتیدیوم بروماید رنگ امیزی شد. از ضریب تشابه جاکارد برای تعیین تشابه جدایه ها و از روش UPGMA و نرم افزار NTYSYS-pc نسخه 2 برای آنالیز خوشه ای استفاده شد. آنالیز خوشه ای نتایج به دست آمده نشان داد که در سطح تشابه 33 درصد ، جدایه ها به 6 گروه قابل تقسیم اند. لذا تنوع قابل توجهی در جمعیت های این باکتری در مازندران وجود دارد.

کلیدواژه ها:

گیاهچه های برنج ، تنوع ژنتیکی ، استان مازندران ، نوار قهوه ای برنج ، BOX-PCR