بررسی تنوع ژنتیکی ارقام انگور سیستان با استفاده از مارکر مولکولی RAPD

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی و ارزیابی ارقام انگور در سطح مولکولی از نشانگر رپید استفاده شد. در این تحقیق 6 ژنوتیپ انگور متعلق به مناطق مختلف سیستان با 31 آغازگر مورد ارزیابی قرار گرفتند. از 31 پرایمر تست شده روی DNA ژنومیکی، 21 پرایمر برای آنالیز ژنتیکی انتخاب شدند. پرایمرهای انتخاب شده 497 باند واضح و آشکار تولید کردند. تکثیر حاصله باعث ایجاد باندهای در محدوده اندازه های بین 300 تا 3500 جفت باز شد. این باندها به صورت ماتریس (1 و 0 ) که به ترتیب حضور باند (1) و عدم حضور باند (0) امتیاز بندی شدند. ماتریس حاصله به روش UPGMA تجزیه گردید. برای رسم دندوگرام فواصل ژنتیکی ارقام به وسیله تجزیه کلاستر به کار گرفته شد و در نهایت ارقام مطالعه شده در 4 گروه اصلی طبقه بندی شدند که ارقام یاقوتی قرمز و سفید دارای بیشترین تشابه (0/672) و ارقام قرمز و لعل دارای کمترین تشابه (0/411) بودند. در این تحقیق با توجه به باندهای چندشکل کارایی نشانگر رپید جهت گروه بندی ارقام تأیید شد.

کلیدواژه ها:

پلی مورفیسم ، تشابه ژنتیکی ، پرایمر تصادفی ، UPGMA ، ماتریس تشابه ، RAPD