تشخیص مولکولی و همسانه سازی ژن پروتئین پوششی (CP) و تعیین جایگاه تکاملی جدایه ایرانی ویروس پیچیدگی برگ سیب زمینی (Potato leaf roll virus, PLRV)

یکی از ویروس های مهم در قسمتهای مرکزی و جنوب شرقی ایران ویروس PLRV است. طی نمونه برداری از مناطق کاشت سیب زمینی جیرفت در استان کرمان گیاهان آلوده به PLRV بر اساس علائمی شامل زردی و پیچیدگی برگ جمع آوری و آلودگی آنها به PLRV به وسیله آزمون های ELISA با استفاده از آنتی سرم تجاری ویروس تأیید شد. ژن پروتئین پوششی PLRV با یک جفت آغازگر اختصاصی از سریق واکنش زنجیره ای پلیمراز (RT-PCR) تکثیر شد. قطعه تکثیر شده، با استفاده از باکتری Eschericha coli نژاد DH5α همسانه سازی و سپس تعیین توالی گردید. توالی به دست آمده با توالی های ژن CP ویروس فوق موجود در بانک ژن مقایسه گردید. نتایج حاصل از این مقایسه نشان داد که ژن CP جدایه ایرانی بیشترین شباهت را با جدایه ای از لهستان (99/4%) و کمترین شباهت را با جدایه استرالیا (96/8%) دارد.

کلیدواژه ها:

ویروس پیچپدگی برگ سیب زمینی ، پوشش پروتئینی ، RT-PCR ، همسانه سازی ، آنزیمهای برشی