مطالعه تنوع ژنتیکی قارچ عامل بیماری پوسیدگی ریشه و زوال خربزه در ایران

بیماری پوسیدگی ریشه و زوال خربزه ناشی از Monosporascus cannonballus یکی از مهمترین بیماری های قارچی خربزه در ایران می باشد. با توجه به جدید بودن این بیماری، اطلاعی از ساختار ژنتیکی جمعیت های قارچ عامل بیماری در ایران در دست نمی باشد. در این بررسی، جدایه های M. cannonballus از بوته های آلوده طالبی، خربزه و هندوانه از استانهای مختلف کشورجمع آوری شدند. تنوع ژنتیکی موجود در جمعیتهای این بیمارگر در یک نمونه مشتمل بر 50 جدایه با استفاده از روش rep- PCR و آغازگرهای ERIC1 و 2 BOX با تکثیر قطعاتی از DNA تعیین گردید. اندازه قطعات تکثیر شده بین 100 تا bp 1500 در نوسان بود. تجزیه خوشه ای با استفاده از ضریب تشابه دایس و روش UPGMA هایی که از مناطق مختلف جمع آوری شده بودند نشان داد. بین ظاهر پرگنه جدایه ها در محیط کشت، بیماریزایی و گروه ژنتیکی آنها ارتباط وجود داشت به طوریکه بر این اساس و در سطح تشابه 80 % جدایه ها در سه گروه مختلف قرار گرفتند. قدرت تمایز بالای این نشانگر نشان داد که می توان از rep-PCR به عنوان یک روش مفید و سریع برای بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های Monosporascus cannonballus استفاده کرد.

کلیدواژه ها:

rep-PCR ، تنوع ژنتیکی ، Monosporascus cannonballus ، مارکرهای ملکولی