استفاده از ترکیب معیار همبستگی، شبکه های عصبی و الگوریتم ژنتیک برای انتخاب چند شکلی های تک نوکلئوتیدی(SNP)مهم
محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 447
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI07_0401
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
در طول دههی گذشته، استفاده از روشهای انتخاب ویژگی در بیوانفورماتیک به یک نیاز اساسی برای ساخت مدل تبدیل شده است. این امر به خاطر بالا بودن ابعاد دادهها در علوم مختلف بیوانفورماتیک، مثل انتخاب SNP. ها، میباشدSNPهااطلاعات مفیدی را جهت تشخیص ژنهای مرتبط با بیماریهای دارای مکانیزم توارثی پیچیده مثل انواع سرطان، دیابت،بیماریهای عروقی و برخی انواع بیماریهای ذهنی فراهم میکنند. بنابراین، استفاده از روشهای کاهش ابعاد اجتناب ناپذیر شده است. در این مقاله، ما از یک روش ترکیبی جهت انتخابSNPهای مهم موجود در یک مجموعه از بانکهای اطلاعاتی استفاده کردهایم. در روش پیشنهادی ما، ابتدا الگوریتم انتخاب ویژگی مبتنی بر همبستگی اجرا میشود و تعداد کمتری از ویژگیهای ورودی را انتخاب میکند. سپس این ویژگیها به عنوان ورودی مرحلهی دوم، یعنی شبکهی عصبی استفاده می شوند. ویژگیهای انتخاب شدهی نهایی، در واقع مهمترین SNPهای موجود در بانک اطلاعاتی میباشند. نتایج حاصله نشان دهندهی دقت قابل قبول و زمان محاسباتی مناسب الگوریتم پیشنهادی در تشخیص SNPهای مهم میباشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
حمید صنعت نما
استادیار بخش مهندسی کامپیوتر دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی کرمان
علی اسماعیلیزاده کشکوئیه
دانشیار بخش علوم دامی دانشگاه شهید باهنر کرمان
فریده هلاکو
دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی ITدانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی کرمان
مهدی افتخاری
استادیار بخش مهندسی کامپیوتر دانشگاه شهید باهنر کرمان
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :