استفاده از rep-PCR در بررسی چند شکلی ژنومی بین جدایه هایPseudomonas syringae pvsyringae عامل بلایت باکتریایی گندم دراستان های اردبیل و گیلان

باکتری Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) عامل بیماریهای متعددی روی محصولات زراعی و باغی می باشد که در گندم باعث سوختگی باکتریایی میشود. در کل 45 جدایه به دست آمده از مزارع گندم استانهای اردبیل و گیلان مورد بررسیهای فنوتیپی (مورفولوژیکی، فیزیولوژیک و بیوشیمیایی) و الکتروفورز پروتئین محلول سلولی قرار گرفتند. جدایه ها بر اساس خصوصیات فنوتیپی و الگوی پروتئین های سلولی اختلافات جزئی نشان دادند. به منظور ارزیابی دامنه تنوع ژنتیکی جدایه هایDNA ،Pss ژنومی جدایهها استخراج و در واکنش زنجیرهای پلیمراز با روشهای BOX-PCR و REP ،ERIC (rep-PCR) بررسی شد. از ضریب تشابه جاکارد برای تعیین تشابه جدایه ها و از روش UPGMA و نرم افزار NTSYS-pc نسخه 2.02 برای آنالیز خوشه ای استفاده شد. آنالیز خوشهای نتایج به دست آمده نشان داد که در ERIC-PCRدر سطح تشابه 67 درصد، جدایهها به 8 گروه، با REP-PCRبه 6 گروه، با BOX-PCRبه 7 گروه و با ترکیب همه آغازگرها به گروه تقسیم شدند. نتایج نشانگر وجود تنوع ژنتیکی درون جدایه هایPssعامل بیماری بلایت باکتریایی گندم بود.

کلیدواژه ها:

تنوع ژنتیکی ، Pss ، بلایت باکتریایی ، گندم