مقایسه رو شهای نرما لسازی و تعیین ژن در داده های میکروآرایه cDNA

بیان ژن، پدیده ای اساسی در حیات موجودات زنده می باشد. از مهمترین رو شهای تعیین بیان ژن در سطح رونویسی، تکنولوژی میکروآرایه هایcDNAبوده که قادرند بیان ده ها هزار ژ ن را بطور همزمان انداز هگیری کنند. اما آزمایش های میکروآرایه از ابتدا تا تولید داد ههای خام، در معرض تغییرات نامطلوبی بوده که ناشی از بایاس های آزمایشگاهی و تکنیکی هستند. جهت حذف یا حداقل کردن این تغییرات، رو شهای آماری تحت عنوان تکنیک های نرمال سازی با فرضیات آماری و بیولوژیکی متفاوت پیشنهاد شده است. پنج روش نرمال سازی به صورت منفرد و ترکیبی(در کل یازده روش) جهت پردازش مجموعه داد ه یApoAI بر اساس شناسایی هشت ژن دارای تنظیم پایین مقایسه شدند. نتایج آنالیزها نشان داد که روش نرمال سازی twoDloessبه صورت منفرد و ترکیبی با روشmedian بهترین عملکرد را بر روی این مجموعه داد ه ها نشان می دهد. همچنین استفاده از P-valueبه تنهایی نتایج بهتری از کاربرد همزمان P-valueو تغییرات چند برابری(Fold change) در مرحل هی تعیین ژن های با بیان متفاوت( Feature selection) حاصل می کند.

کلیدواژه ها:

بیان ژن ، میکروآرایه ، نرمال سازی ، تعیین ژن