آنالیز فیلوژنتیک ژن P5CSدر گونههای مختلف بر اساس توالیهای کد کننده با استفاده ازتکنیکin silico AFLP
محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 482
فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI07_0591
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
ژن پرولین 5 کربوکسیلات سینتاز (P5CS)در پاسخ گیاهان به تنش های شوری و خشکی نقش مهمی ایفا می کند . به منظور بررسی روابط فیلوژنتیکی این ژن در هشت گونه گیاهی، آنالیز in silico AFLPبر روی توالی های کد کننده(cDNA) آن انجام شد. پس از هضم آنزیمی توالیها توسط دو آنزیم برشی HpyF44III و EcoVIIIپروفیل قطعات حاصل ترسیم شد پروفیل قطعات تولید شده نشان داد که 10 باند مشترک (هم اندازه) در بین گونه ها وجود دارد. کوچکترین و بزرگترین قطعه به ترتیب دارای 14 جفت باز در گونهEuonymus japonicus و 973 جفت باز در گونه درخت فیلوژنتیکی حاصل از این آنالیز با استفاده از روش حداکثر درست نمایی و الگوریتمNeighbor joining هشت گونه مورد مطالعه را در 4 کلاستر قرار داد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سجاد منصوری
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه ایلام
هادی خارستانی
دانش آموخته کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه ایلام
محمد حیدرنژادیان
دانش آموخته کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرمانشاه
هوشنگ ناصری راد
عضو هیئت علمی دانشگاه پیام نور استان ایلام
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :