بررسی بیوانفورماتیکی عملکرد ژن FTدر گلسرخیان

مهمترین تغییر نموی در چرخه زندگی گیاهان شروع گلدهی می باشد. بسیاری از گونه های گیاهی در رابطه با توانایی گلدهی طوری تکامل یافته اند که گلدهی خود را در پاسخ به تغییرات محیطی مانند تغییر طول روز یا دما تنظیم کنند. ژن متصل می شوند. اگرچهFlowering Locus TیاFT (accession number EU939302 ) یک پروتئین اتصال فسفاتیدیل اتانول آمین می باشد، که در شرایط طول روز بلند تحت تاثیر ژنCOدر برگ ها فعال شده و پس از انتقال به مریستم انتهایی نقش کلیدی در تولید جوانه گل بازی در برگ ها فعال شده و پس از انتقال به مریستم انتهایی نقش کلیدی در تولید جوانه گل بازیCis-elementهای موجود، جهت بالا بردن آگاهی و نحوه عملکرد آن حائز اهمیت می باشد. با بدست آوردنCDSژنFTازNCBIحدود1500 جفت باز از ناحیه پروموتری این ژن از سایت Phytozome گرفته شده و سپس آنالیز پروموتر با استفاده از دو سایت Plant CARE و PLACE انجام شد. نتایج نشان داد که 21 مورد جعبه TATAبه عنوانCore promoterدر بالا دست ژنFTوجود داشت. حدود17موردCis-elementپاسخ دهنده به نور و ریتم سیرکادین در این پروموتر مشاهده شد که بیانگر ایناست که به طور عمده عامل های رونویسی درگیر در مکانیسم های نوری به این نواحیCis-element متصل می شوند. اگرچه که P-boxبه عنوان Cis-element پاسخ به هورمون جیبرلیک اسید و MBSبه عنوانCis-elementاتصال به عاملرونویسیMYBدرگیر در تنش های محیطی مثل خشکی و شوری نیز در این پروموتر وجود دارد. استفاده از این گونه پروموترها جهت استفاده در کاست های ژنی در بالا دست ژن های موثر در گلدهی، نه تنها در تسریع گلدهی بلکه در مطالعات فیزیولوژیکنیز حائز اهمیت می باشد. از طرفی با تسریع و تاخیر زمان گلدهی با استفاده از پروموتر یا ژن خاص به ویژه در گیاهان تراریخت(دارای ژنهای مقاومت به یک آفت کش یا آنتی بیوتیک یا ژن های موثر در نابود کردن آفت خاص و غیره) امکان انتقال دانه گرده این گیاهان به گیاهان مجاور خود را به حداقل می رسانیم. برای درک وسیع تر ژنFT شناسایی شبکه های ژنی مرتبط با آن راه کاری ارزنده است. بررسی پروموتر ژن های موجود در این شبکه ژنی منجر به شناسایی عناصر تنظیمی اختصاصی جدیدی خواهدشد که در تهیه پروموتر های مصنوعی به منظور اهداف چند گانه موثر خواهند بود. با توجه به مشکل جهانی گرم شدن کره زمین وتغییر در رفتار گلدهی گیاهان، استفاده از این گونه پروموتر ها در مدیریت تنظیم زمان گلدهی در گیاهان حائز اهمیت خواهد بود.

کلیدواژه ها:

آنالیز پروموتر ، شبکه ژنی ، بیوانفورماتیک ، گلدهی FT