آنالیز ترانسکریپتوم آلوروپوس لیتورالیس در پاسخ به شوری

تنش شوری یکی از مهمترین فاکتورهای محیطی محدود کننده رشد و تولید گیاهان زراعی محسوب میشود. به منظور تحلیل افتراقی الگوی بیان ژن در اندام هوایی هالوفیت littoralis Aeluropus در پاسخ به شوری، از روش چندشکلی طولی قطعات تکثیر شده ی دی ان آی مکمل (cDNA-AFLP) استفاده شد. تیمار شوری در شرایط هیدروپونیک و در سطوح 450.250.120.0 و 600 میلی مولار کلریدسدیم اعمال شد. مطالعات فیزیولوژیک نشان داد که میزان رشد این گیاه هالوفیت در غلظتهای 120 و 250 میلی مولار شوری نسبت به شاهد افزایش یافته است. آنالیز ترانسکریپتوم با استفاده از 56 ترکیب پرایمری امکان شناسایی 3078 (Transcription derived factor)TDF تکرارپذیر در محدوده باندی 100 تا1000 جفت باز را میسر ساخت که به 5 گروه بیانی متفاوت شامل افزایش بیان نسبت به شاهد (% 11 )، کاهش بیان نسبت به شاهد (% 6)، خاموش شدن در اثر اعمال تنش (% 10 )، بیان شدن در اثر اعمال تنش (% 12 ) و نهایتا TDF های بدون تغییر( %61) دسته بندی شدند. نتایج نشان داد که تکنیک cDNA-AFLP یک روش قدرتمند و تکرارپذیر جهت آنالیز ترانسکریپتوم گیاه آلوروپوس لیتورالیس بوده که با استفاده از آنالیز جامع ژنهای بیانی، جداسازی ژنهای کاندید در تنش شوری را بدون نیاز به داشتن توالی پیشین امکانپذیر می سازد.

کلیدواژه ها:

Aeluropus littoralis ، cDNA-AFLP ، TDF ، تنش شوری ، بیان ژن