بررسی بیوانفورماتیکی توالیهای پلیپپتیدی بدست آمده از سه ژن تیوردوکسین نوع انگور: پیش h بینی ویژگیهای بیوشیمیایی، ساختاری و عملکردی

سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 438

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI07_0835

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

ویژگیهای بیوشیمیایی، ساختاری و عملکردی توالیهای پلیپپتیدی بدست آمده از سه ژن تیوردوکسین نوع ،VvTrx h شامل 1 h VvCxxS و 2 VvTrx h2 همسانهسازی شده از بافت حبه انگور ،(Vitis vinifera L.) با استفاده از برنامههای بیوانفورماتیکی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. بررسیهای بیوشیمیایی نشان دادند که توالیهای پلیپپتیدی بدست آمده، از جمله پروتئینهای مقاوم برابر حرارت بوده و به ترتیب 115. 114 . 126 آمینواسید طول دارند. با اینکه موقعیت سلولی آنها سیتوزولی است، اما بررسی های بیوانفورماتیکی نشان داد که برخلافVvCxxS2 توالی های پلیپپتیدی VvTrx h1 و 2 VvTrx h با داشتن موتیف های ساختاری درگیر در انتقال سلول به سلول و اضافه شدن گروههای لیپیدی مانند Myristate و Palmitate پس از فرآیند ترجمه، از طریق پلاسمودسماتا قادر به مهاجرت از سلولی به سلول دیگر میباشند. با بررسیهای مدلسازی سهبعدی نشان داده شد که توالی های پلیپپتیدی بدست آمده همانند سایر تیوردوکسینها حاوی پنج رشته b مرکزی احاطه شده توسط چهار مارپیچ a با آرایش β1α1β2α2β3α3β4β5α4 میباشند. همچنین، بررسیهای مدلسازی تداخلی پیشنهاد نمودند که VvTrx h و 2 VvTrx h می توانند توسط آنزیم NADPH تیوردوکسین ردوکتاز VvCxxS و 2 (NTR) بوسیله آنزیم گلوتاردوکسین(Grx) احیاء شوند.

نویسندگان

رضا حیدری جاپلقی

دانش آموخته کارشناسی ارشد رشته بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره)، قزوین، ایران

رحیم حداد

استادیاران گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده فنی- مهندسی، دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره)، قزوین، ایران.

قاسمعلی گروسی

استادیاران گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده فنی- مهندسی، دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره)، قزوین، ایران.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Foyer, C. H., Noctor, G., 2005. Redox homeostasis and antioxidant ...
  • Gelhaye, E., Rouhier, N., Jacquot, J. P., 2004. The thioredoxin ...
  • Ishiwatari, Y., Fujiwara, T., McFarland, K. C., Nemoto, K., Hayashi, ...
  • Maeda, K., Finnie, C., Ostergaard, O., Svensson, B., 2003. Identification, ...
  • Meng, L., Wong, J. H., Feldman, L. J., Lemaux, P. ...
  • Russell, R. B., Breed, J., Barton, G. J., 1992. Conservation ...
  • Zhang, Y., 2008. I-TASSER server for protein 3D structure prediction. ...
  • نمایش کامل مراجع