تعیین ژنوتیپ سویه های توکسیژنیک کلستریدیوم پرفرینجنس با استفاده از روش Multiplex PCR در شترمرغ

کلستریدیوم پرفرینجنس یک باکتری بی هوازی، گرم مثبت و اسپورزا است که علاوه بر ایجاد انواع مختلف انتروکسمی در دام، به عنوان یکی از عوامل مسمومیت غذایی شناسایی شده است. سویه های کلستریدیوم پرفرینجنس حداقل 15 توکسین تولید می کنند که چهار گروه اصلی توکسین این باکتری شامل (a)، (B)، (E) و (i) می باشد. جهت شناسایی ژنوتیپ های مختلف این باکتری روش های متفاوتی وجود دارد. هدف از انجام این تحقیق استفاده از روشهای پیشرفته ی مولکولی به منظور تعیین ژنوتیپ های مختلف باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس بود. در این مطالعه 120 نمونه مدفوع از شترمرغ های 12 مزرعه بطور تصادفی و در دو مرحله گرفته شد. پس از فرآوری و کشت نمونه ها، کلونی های حاصل از نظر ساختاری و رنگ آمیزی بررسی و با استفاده از آزمایش های بیوشیمیایی، گونه ی آنها شناسایی شد. استخراج DNA فقط بر روی کلستریدیوم پرفرینجنس انجام شد. واکنش PCR با پرایمرهای اختصاصی هر تیپ انجام و سپس جهت تعیین ژنوتیپ سویه های کلستریدیوم پرفرینجنس ، از روش Multiplex PCR استفاده شد. تنها تیپ جدا شده ی کلستریدیوم پرفرینجنس تیپ A بود که جداسازی انواع کلستریدیا از شترمرغ و تعیین ژنوتیپ کلستریدیوم پرفرینجنس با روش Multiplex PCR برای اولین بار در دنیا، توسط این مطالعه در ایران انجام گردید.

کلیدواژه ها:

کلستریدیوم پرفرینجنس ، آزمایش های بیوشیمیایی ، Multiplex PCR