روابط فیلوژنتیکی برخی جدایی های Phytophthora capsici از میزبانها و مناطق جغرافیایی مختلف

گونه ی Phytophthora capsici یک بیمارگر گیاهی است که با داشتن دامنه ی میزبانی وسیع و حمله به گیاهان مختلف سبب خسارت اقتصادی قابل توجهی در سراسر دنیا میشود. اطلاع از ساختارهای جمعیتی P. Capsici در کنترل آن با استفاده از ارقام مقاوم ضروری است، زیرا برنامه های بهنژادی میبایست شامل جدایه هایی باشد که تنوع ژنتیکی بیمارگر را در غربال مقاومت نشان دهد. در این پژوهش، به منظور یافتن ساختارهای جمعیتی احتمالی در چدایه های ایرانی، توالیهای جداکننده ی نسخه برداری شدهی داخلی (آی تیاس) یک و دو دیانای ریبوزومی در جدایه های P. capsici متعلق به میزبانها و مناطق جغرافیایی مختلف مورد مطالعه قرار گرفت. بررسی نتایج مشخص کرد که دو جدایه از جدایه های مطالعه شده در این پژوهش P. tropicalis میباشند که به دلیل شباهتهای ریختشناختی به اشتباه به عنوان P. capsici تشخیص داده و در کلکسیون نگهداری شده بودند. درخت فیلوژنتیکی حاصل از واکاوی پیوست همسایگی نشان داد که تمام جدایه های P. capsici و P. tropicalis که در این تحقیق مورد بررسی قرار گرفته بودند، به تبار دو از درخت آیتیاس فیتوفتورا تعلق دارند. در برخی مناطق از توالی های آیتیاس جدایه های P. capsici چندشکلی تک نوکلئوتیدی مشاهده شد که این امر نشان دهنده ی وجود رگه های مجزا در جمعیت است. اما هیچ ساختار جمعیتی براساس میزبان یا منطقه جغرافیایی مشاهده نگردید.