مطالعه بیوانفورماتیکی و شناسایی موتیف های موجود در پروموتر ژن های گیرنده های شبه کینازی در آرابیدوپسیس تالیانا

بررسی و شناسایی موتیف های شناخته شده در پروموتر ژن های مهم و پیش بینی تغییر بیان این ژن ها تحت تاثیر تنش های زنده وغیرزنده با استفاده از تکنیک های رایانه ای یکی از زمینه های جذاب در بیوانفورماتیک است. با استفاده از بانک اطلاعاتی TAIR توالی 10 ژن رمز کننده گیرنده های شبه کینازی از آرابیدوپسیس تالیانا جمع آوری و با استفاده از برنامه های PlantCARE و AGRIS مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند و موتیف های موجود در آنها بررسی شدند. نتایج نشان دادند که توالی پروموتر این ژن ها شامل عناصر تنظیمی مختلفی مانند CAAT box TATA box ، ABRE box عناصر پاسخ به زخم، خشکی و غیره است که باعث القای بیان ژن های رمز کننده گیرنده های شبه کینازی در طول رشد و نمو و تحت تنش های زنده و غیرزنده می شود. نتایج این پژوهش نشان داد که گیرنده های شبه کینازی به احتمال زیاد علاوه بر موثر بودن در تحمل به تنش های شوری و خشکی، پاسخ به زخم در بسیار دیگر از فعالیت های فیزیولوژیک گیاه به طور مستقیم یا غیر مستقیم نقش دارند.

کلیدواژه ها:

گیرنده های شبه کینازی ، عناصر تنظیمی ، تنش های زنده وغیر زنده