استفاده از نشانگرهای ساده تکرار شونده در بررسی گروه بندی ژنوتیپ های جو دیم

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های جو دیم، از 14 جفت آغازگرSSR بر روی 20 ژنوتیپ جو استفاده شد. استخراج DNA به روش DART با اندکی تغییر انجامم شد. 14 جفت آغازگر درمجموع 424 باند چند شکل را تولید نمودند. در این مطالعه متوسط تعداد باند به ازای هر آغازگر 43/30 عدد و برای هر ژنوتیپ 21/3 عدد بود . بیشترین میزان اطلاعات چند شکلی(PIC) مربوط به آغازگرهای Hvm60 و Hvm20 به ترتیب با مقادیر 0/88 و 0/73 بود و کمترین مقدار آن مربوط به آغازگر Bmac0032 با مقدار 0/32 بود. میانگین PIC برای کل آغازگرها 0/6 به دست آمد. با محسابه ضریب تشابه جاکارد، ارزش های تشابه بین ژنوتیپ ها دامنه ای از 0/3 تا 0/96 را داشتند. بیشترین تشابه ژنتیکی مربوط به ژنوتیپ های شماره6 (رقم زراعی) و شماره 5(لاین امید بخش ) با 0/96 بود و کمترین تشابه مربوط به شماره 13(پوشینه دار) و شماره 10(پوشینه دار) با 0/3 بود. در این پژوهش دندروگرام حاصل از تجزیه خوشه ای به روش UPGMA و با استفاده از نرم افزار NTSYS ترسیم شد که ژنوتیپ های مورد مطالعه در 5 گروه اصلی قرار گرفتند. تفکیک براساس داده های مولکولی SSR تا حدودی توانست ژنوتیپ های دو و شش ردیفه و همچنین ژنوتیپ های دانه پوشیده و بدون پوشینه را از هم تفکیک نماید.

کلیدواژه ها:

تنوع ژنتیکی ، جو ، پوشینه ، SSR