بررسی خصوصیات یک پروتئین ناشناخته در گیاه برنج با استفاده از ابزارهای بیوآنفورماتیکی

بیوآنفورماتیک و روش های محاسباتی ابزاری موثر در مطالعه پروتئین می باشند. دراین مطالعه یک توالی پروتئینی ناشناخته ثبت شده به شماره دسترسی BAD81308.1 برای بررسی و مطالعه ساختار و عملکرد احتمالی مورد استفاده قرار گرفت. پس از BLAST توالی مورد نظر برعلیه دیتابیس پروتئین غیرتکراری و مقایسه تعدادی از توالی های استخراج شده دارای همولوژی بالابا این پروتئین، تعدادی از دامینها و موتیف های مهم موجود در این پروتئین شناسایی شدند. پروتئین مورد مطالعه به طور اختصاصی باگروهی از پروتئین های باند شونده به DNA تحت عنوان RPA1-DBD-Like همولوژی نشان داد. نتیجه این همولوژی شناسایی دو دمین A و B ازاین پروتئین برروی توالی مذکور بود.

کلیدواژه ها:

بیوآنفورماتیک ، پایگاه داده پروتئین ، سطح باند شونده ، دومین