مطالعه فیلوژنتیک باکتری عامل لکه زاویه ای توسکای ییلاقی از طریق بررسی ژن dnaK

یکی از گونه های مهم در تولید چوب گونه توسکای ییلاقی (Alnus subcordata) است. این گونه با داشتن قدرت تثبیت کنندگی ازت خاک و با بیومس تولیدی زیاد به منظور رزاعت چوب و همچنین جنگل کاری برای احیای مناطق مخروبه جنگل های شمال کشور بسیار مناسب است. در چند سال اخیر بیماری لکه برگی ناشی از گونه ای زانتوموناس در توسکا ییلاقی در جنگل های استان مازندران گزارش شده است که گونه آن هنوز به طور دقیق شناسایی نشده است. لذا هدف اجرای تحقیق حاضر تعیین موقعیت تاکسو نومیکی باکتری زانتوموناس عامل لکه زاویه ای توسکای کشور با استفاده از بررسی توالی ژن dnaK به عنوان یکی از ژن های خانه دار و حفاظت شده بود. در این راستا تعداد 14 جدایه باکتری که قبلا با استفاده از آزمون های بیماری زایی، بیوشیمیایی والگوی نقوش پروتئینی مورد ارزیابی قرار گرفته بودند ، استفاده شد.پس از طراحی و ساخت پرایمرهای اختصاصی ژن dnaK تکثیر قطعه 730 نوکلئوتیدی در جدایه ها صورت پذیرفت. پس از خالص سازی و توالی یابی قطعات تکثیر شده همردیف سازی چندگانه( Multiple sequence alignment) با سایر توالی های موجود در بانک داده NCBI، نتایج نشان داد که جدایه های بومی دارای تنوع خوبی در توالی ژن مذکور می باشند. با این حال توالی های بدست آمده از جدایه های مذکور بیش از 98 درصد با توالی های ژن dnaK در گونه Xanthomonas arboricola شباهت داشتند. این نتایج بیانگر این است که عامل این بیماری در توسکای ییلاقی در کشور متعلق به جنس و گونه Xanthomonas arboricola می باشد.

کلیدواژه ها:

عامل لکه برگی ، روابط فیلوژنتیکی ، توسکای ییلاقی ، dnaKژن ، Xanthomonas arboricola