شناسایی بیوانفورماتیکی ژن های هدف چند میکرو RNA جدید در انگور

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 752

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NCER03_028

تاریخ نمایه سازی: 27 بهمن 1394

چکیده مقاله:

میکرو RNA1 ها کلاسی از RNA های کوچک 24-20 نوکلئوتیدی درون زاد هستند که نقش های مهمی را در تنظیم پساز ترجمه ژن طریق هدف قرار دادن mRNA ها برای برش یا سرکوب ترجمه ایفا می کنند. تمام پیش سازهای miRNAs دارای ساختارهای ثانویه حفظ شده مشابهی هستند که به کمک آن و با استفاده از روش های محاسباتی، وجود اورتولوگ ها یا همولوگ های میکرو RNA های جدید را در دیگر گونه های گیاهی می توان پیشبینی کرد. بر این اساس و پساز رعایت مجموعه ای از ضوابط، تعداد 25 میکرو RNA جدید متعلق به 3 خانواده mir-845 و mir-5523 و mir-171 در انگور شناسایی شد. به منظور درک نقش miRNAs جدید در شبکه های تنظیم ژن در انگور، تعداد 27 ژن هدف برای این 3 خانواده miRNAs با استفاده از پایگاه اطلاعاتی psRNATarget شناسایی شد که بیانگر عملکرد آنها در پروسه های مختلف بیولوژیکی از جمله متابولیسم، نمو، کنترل تقسیم سلولی، مورفوژنز و انتقال سیگنال است. این داده ها اطلاعات مفیدی را پیرامون توصیف عملکرد miRNAs در انگور فراهم آورد.

نویسندگان

سهیلا فاطمی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی، گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه کردستان

بهمن بهرام نژاد

دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه کردستان

جلال رستم زاده

استادیار گروه علوم دامی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • شناسایی بیوانفورماتیکی میکرو RNA ها در انگور [مقاله کنفرانسی]
  • Bai, M., Yang, G. S., Chen, W. T., Mao, Z. ...
  • Barozai, M. Y. K. (2012). In silico identification of micrornas ...
  • Bartel, D. P. (2004). MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function. ...
  • Chiou, T. J., Aung, K., Lin, S. I, Wu, C. ...
  • Das, A., & Mondal, T. K. (2010). Computational identification of ...
  • Din, M., Barozai, M. Y. K., & Baloch, I. A. ...
  • Ding, D., Zhang, L., Wang, H., Liu, Z., Zhang, Z., ...
  • Eldem, V., Okay, S., & Unver, T. (2013). Plant microRNAs: ...
  • Guo, N., Ye, W., Yan, Q., Huang, J., Wu, Y., ...
  • Heo, J. O., Chang, K. S., Kim, I. A., Lee, ...
  • Li, B., Qin, Y., Duan, H., Yin, W., & Xia, ...
  • Pandey, B., Gupta, O. P., Pandey, D. M., Sharma, I., ...
  • Patanun, O., L e rtp anyasampatha, M., Sojikul, P., Viboonjun, ...
  • Sunkar, R., Chinnusamy, V., Zhu, J., & Zhu, J. K. ...
  • Thiebaut, F., Rojas, C. A., Almeida, K. L, Grativol, C., ...
  • Wang, C., Shangguan, L. F., Nicholas, K. K., Wang, X. ...
  • Dai, X., & Zhao, P. X. (2011). psRNATarget: a plant ...
  • Xie, M., Zhang, S., & Yu, B. (2015). microRNA biogenesis, ...
  • Ye, K., Chen, Y., Hu, X., & Guo, J. (2013). ...
  • Yin, Z. J., & Shen, F. F. (2010). Identification and ...
  • Zhao, M., Tai, H., Sun, S, Zhang, F., Xu, Y., ...
  • نمایش کامل مراجع