بررسی جایگاه های ژنومی موثر بر طول سرپستانک های جلویی و عقبی گاومیش های استان خوزستان با روش پویش ژنومی

هدف از انجام این مطالعه شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با طول سرپستانک های جلویی و عقبی گاومیش های استان خوزستان می باشد در این مطالعه از تعداد 121 نمونه از گاومیش های شهرستان های گاومیش خیز استان خوزستان ازگله هایی که تحت پوشش سیستم ثبت مشخصات و رکورد گیری شیر قرار داشتند نمونه گیری شد. نمونه ها با استفاده از تراشه ژنومی اختصاصی گاومیش با تعداد 90 هزار نشانگر SNP تعیین ژنوتیپ شدند. سپس جایگاه های با حداقل فراوانی آللی (MAF ) کمتر از 0/01، تعادل هاردی واینبرگ آنها کمتر 6-10 و نرخ خوانش آنها کمتر0.05 بود، کنار گذاشته شدند.سپس با استفاده از نرم افزار PLINK ارتباط این صفات با ژنوم گاومیش ها مورد بررسی قرار گرفت و توسط نرم افزار R نمودار منهتن برای این آنها رسم گردید.که نشان می دهد SNP هایی که برروی کروموزوم های 23،19 و30 قرار دارند بر روی طول سرپستانک های جلویی وSNP هایی که بر روی کروموزوم های 7،1 و 26 قرار دارند بر روی طول سرپستانک های عقبی تاثیر دارند.

کلیدواژه ها:

پویش کل ژنومی ، گاومیش ، تنوع تک نوکلیوتیدی ، جایگاه صفات کمی