شناسایی مولکولی و بررسی فیلوژنتیکی ناحیه 16srRNA باکتری لاکتوباسیلوس پلانتاروم جداشده ازدونمونه خمیر ترش تربت و بوکر آلمان

بررسی ژنتیکی فلورمیکروبی خمیرترش سبب شناخت اکولوژیکی و خصوصیات کارکردی و دربهتر رقابت تطابق متابولیسم و پاسخ تنشی میکروارگانیسم ها شده است روشهای مستقل ازکشت همچون واکنش زنجیره ای پلیمراز به منظور تعیین تنوع میکروارگانیسم ها دراکوسیستم های طبیعی و نمایه نمودن آنها جهت بررسی سیرتکامل جمعیتهای میکروبی توسعه یافته اند با این هدف شناسایی مولکولی لاکتوباسیل جداشده ازدونمونه خمیرترش محلی تربت جام وآآلمان سنتی و صنعتی با استفاده ازروش مولکولی درسطح DNA انجام شد بدین منظور خمیرترش براساس خصوصیات ارگانولپتیکی عطروطعم ازشهرستان تربت جام جمع اوری گردید پپس ازاستخراج DNA ازخمیرتکثیر قطعه 253جفت بازی ازژن 16s RNA ریبوزومی توسط اغازگرهای مختص شناسایی لاکتوباسیل انجام گرفت سپس قطعات تکثیر شده تعیین توالی شدند نتایج بدست آمده نشان داد که درموقعیت 205و182 به ترتیب تغییرات نوکلوتیدی T/C,A/C وجود دارد که درموقعیت 18ه2 اسیدامینه هیستیدین به پرولین و درموقعیت 208 اسیدگلوتامین به کدون پایان تغییر یافته است همچنین توالی نهایی بدست آمده ازنمونه تربت با طول 253جفت باز شامل 24/1درصد آدنین و22/1درصد گوانین 27/3درصد سیتوزین و 26/5درصد تیمین بود نتایج فیلوژنتیکی نشان داد که باکتری لاکتوباسیلوس پلانتاروم جداشده ازخمیر ترش تربت کمترین فاصله ژنتیکی با آلمان چین و هلند و بیشترین فاصله ژنتیکی را با فرانسه دارد

کلیدواژه ها:

اسیدلاکتیک ، خمیرترش ، ژن 16s RNA ، تعیین توالی