AIM and NBO analyses of cation–thymine interaction

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 1,243

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NCTCC03_153

تاریخ نمایه سازی: 10 شهریور 1393

چکیده مقاله:

Interaction of the most stable thymine tautomer base (T1) with Li(+), Na(+), K(+), Be(2+) and Mg(2+)was studied to explore the interaction energy (IE) of thymine with cations. All the studiedcomplexes have been optimized at the B3LYP/6-311++G** level of theory in gas phase. The moststable complexes are formed in the location of the O4 atom (T1 Mn+(II). The topological propertiesof the electron density distributions for O-M bonds have been analyzed in terms of the Bader theoryof atoms in molecules (AIM). Natural population analysis data, the electron density and Laplacianproperties, as well as, Mulliken charges have been used to evaluate the cation bonding interactions.The calculated electron density properties for T1M(n+) show that O-M bonds have closed shell andnoncovalent interactions.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

Leila Hokmabadi

PhD student, Faculty member, Payamenoor University, Fariman, Iran

Azadeh Khanmohammadi

PhD student, Payamenoor University, Mashhad, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • -Anastas sopoulou, J., Theophanides, T., (2002) Crit. Rev. Oncol ./Hematol. ...
  • Bader, R. F. W., MacDougall, P. J., Lau, C. D. ...
  • Becke, A.D. (1993) J .Phys. Chem. 98:5648. ...
  • B iegler-Ko nig, F., (2000), _ version 10. ...
  • Dabkowska, I., Gutowski, M., Rak, J., (2005), J. Am. Chem. ...
  • Desfranciois, C.S. Carles, J.P. Schermann, Chem. Rev. 100 (2000) 943. ...
  • Dewar, M.J. _ _ (1985), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, ...
  • Eichhorn, G.L. (1973), Inorganic Biochemistry, Elsevier, New York ...
  • Eichhorn, G.L. (1981) Adv. Inorg. Biochem. 3 :1 ...
  • Frisch MJ, Trucks GW, Schlegel HB, Scuseria GE, Robb MA, ...
  • Stratmann RE, Yazyev O, Austin AJ, Cammi R, Pomelli C, ...
  • Gal, J.F., Maria, P.C, Decouzon, M., M6, O., Yaiez, M., ...
  • Holbrook, S.R., Su ssmanWarrat J.L., Church, R.W.G.M., Kim, S.H., (1977), ...
  • Hongtao, Y., Kwok, Y., Hurley, L.H., Kerwin, S.M. , (2000), ...
  • Ivanov, V.I., Minchenkova, L.E., Minyat, E.E., Frank -Kamenetski i, M.D., ...
  • Liu, F., Qian, P., Yan, S. Bu, Y., (2006), Journal ...
  • Marino, T., Toscano, M., Russo, N., Grand, A.. (2006), J. ...
  • Pan, T., Long, D.M., Uhlenbeck, O.C., (1993), The RNA World, ...
  • Parra, R. D., Ohlssen, J., (2008), J. Phys. Chem. A, ...
  • Ramalho, T.C., Figueroa, J.D -Villar (2002), Journal of Molecular Structure: ...
  • Reed , A.E., Curtiss, L.A., Weinhold, F.A. (1988) Chem. Rev. ...
  • Rodgers, M.T., (2001), J. Phys. Chem. A., 105: 2374-238 ...
  • Serebrov, V.. Clarke, R.J., Gross, H.J., Kisselev, L., (2001), Biochemestry ...
  • Siegbahn, P.E.M., Blomberg, M.R.A. (1999), Annu. Rev. Phys. Che. 50:221 ...
  • Szczpaniak, K. et al. _ the interaction of bare and ...
  • Teeter, M.M., Quigley, G.J., Rich, A., (1980), Nucleic Acid-Metal Interactions, ...
  • Tehrani, Z.A. Fattahi, A., Pourjavadi, A., (2009), Carbohydrate Research, 344:771. ...
  • Zio 1kowski, M., Grabowski, S. J., Leszczynski, J., (2006), J. ...
  • نمایش کامل مراجع