بررسی تنوع ژنتیکی ژن P5CR در گونههای مختلف گیاهی با استفاده از روشin silico AFLP
محل انتشار: اولین همایش ملی دانشجویی بیوتکنولوژی
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 733
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NSCBIO01_120
تاریخ نمایه سازی: 30 فروردین 1392
چکیده مقاله:
پرولین در سلول نقش مهمی را در برطرف کردن تنش اسمزی ایفا می‌کند و از پروتئینهای بزرگ و آنزیمهایی داخل سلول در مقابل دناتورهشدن و همینطور با واکنش با فسفولیپیدهای دیواره غشاء آنها را از آسیب بهوسیله تنش‌های محیطی مانند غلظتهای بالای یونهای معدنی، دمای بالا و افزایش اسیدیته محیط محافظت می‌کند. با توجه به مسیر ساخت پرولین در گیاهان ژن P5CR نقش کلیدی را در تولید پرولین ایفا می‌کند . به منظور بررسی روابط فیلوژنتیکی این ژن در 8 گونه گیاهی، آنالیز in silico AFLP بر روی توالی‌های کدکننده (cDNA) آن انجام شد. بررسی پروفیل حاصل از برش cDNAهای این ژن به وسیله دو آنزیم PSTI و CVIAII نشان‌داد که 8 ناحیه باندی مشترک در بین این گونهها وجود دارد و بزگترین قطعه تولید شده مربوط به گونه Glycine max با طول 744 جفت‌باز و کوچکترین قطعه تولید شده مربوط به Hordeum vulgare، Triticum aestivum و Brachypodium distachyon با طول 28 جفت باز بوده است این سه گونه از خانواده Poaceae میباشند. درخت فیلوژنی حاصل از این آنالیز به روش حداکثر درستنمایی و با الگوریتم نایبرجویننیگ رسم شد که این هشت گونه را در دو دسته و هشت کلاستر قرار داد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سیامک غزالی
سنندج،دانشگاه کردستان،دانشکده کشاورزی،گروه بیوتکنولوژی
خالد میرزایی
۱سنندج،دانشگاه کردستان،دانشکده کشاورزی،گروه بیوتکنولوژی
محمدحسین شمسی فرد
۱سنندج،دانشگاه کردستان،دانشکده کشاورزی،گروه بیوتکنولوژی