بررسی جایگاه ژنتیکی کبک منطقه غرب ایران در دنیا با استفاده از توالیDNA میتوکندری ( mt DNA)

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 677

فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

PDCONF01_256

تاریخ نمایه سازی: 11 آبان 1395

چکیده مقاله:

کبک (Alectoris chukar) یکی از گونه های ماکیان است که در اکثر نقاط پراکنش دارد و جزء پرندگان بومی ایران میباشد. از آنجا که جمعیت ها واحدهای پویای بسیار دقیق و در محدوده پاسخگویی خود، به هر گونه تغییر در شرایط زیست محیطی خود پاسخ میدهند نیاز به بررسی ژنتیکی و بوم شناختی برای شناسایی این تغییرات و حفظ ذخایر ژنتیکی وجود دارد. هدف از این پژوهش تعیین جایگاه آرایه شناختی کبک منطقه غرب ایران در بین سایر کبک های جهان می باشد. در این مطالعه از ژن Cytb از توالی ژنوم میتوکندری با توجه به مزایا و برتری های آن نسبت به سایر نشانگرها استفاده شد. در این مطالعه تعداد سه نمونه بافت کبک از نقاط مختلف استان کرمانشاه جمع آوری و نمونه ها به آزمایشگاه منتقل گردید. پس از استخراج دی ان ای و بررسی کمی و کیفی آن واکنش زنجیره ای پلیمر با استفاده از یک جفت پرایمر اختصاصی رفت و برگشت در حجم 25 میکرولیتر انجام شد. نتایج حاصل از توالی یابی با نرم افزار Seqscape 2.6 ویرایش شدند و با نرم افزار MEGA 5.05 هم آرایی توالی های به دست آمده همراه با سایر توالی های موجود در ژن بانک انجام گرفت و درخت فیلوژنی آن ها با روش حداکثر احتمال و شبکه هاپلوتایبی با استفاده از نرم افزار Network v 4.6.1 رسم شد. نتایج نشان داد که گونه کبک در یک کلاد جداگانه قرار گرفته و فاقد ساختار مشخص است که بیانگر وجود روابط و آمیختگی ژنی در بین این گونه در نقاط مختلف است. سه نمونه ایران در این درخت بسیار نزدیک به هم قرار گرفتند که بیانگر ارتباط ژنتیکی بسیار قوی بین آنها میباشد. هر کدام از نمونه ها در هاپلوتایپ جدا قرار داشتند و فاصله بین این سه هاپلوتایپ نزدیک به هم بود که بیانگر ارتباط ژنتیکی مناسب بین هاپلوتایپ ها می باشد. هر کدام از نمونه ها در هاپلوتایپ جدا قرار داشتند و فاصله بین این سه هاپلوتایپ نزدیک به هم بود که بیانگر ارتباط ژنتیکی مناسب بین هاپلوتایپ ها می باشد و بر همین اساس نتایج درخت فیلوژنی و شبکه هاپلوتایپ همدیگر را تایید می کنند.

کلیدواژه ها:

کبک ، استان کرمانشاه ، هاپلوتایپ ، تنوع ژنتیکی( mt DNA)

نویسندگان

محمد مراد کسانی

دانشجوی کارشناسی ارشد تنوع زیستی و زیستگاه ها دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

حمیدرضا رضایی

عضو هیئت علمی گروه محیط زیست، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • علی‌آبادیان، م. میرشمسی، ا. یزدانی‌مقدم، ف. کارگاه آموزشی کاربرد مطالعات ...
  • فریلند، ج. بومشناسی مولکولی. ترجمه ملکیان، م. انتشارات جهاد دانشگاهی ...
  • منصوری، ج. راهنمای پرندگان ایران، تهران. انشارات کتاب فرزانه، .1387 ...
  • C. KGnig, F. Weick, J.H. Becking, "Owls of the World, ...
  • D.J. Merrell, "Ecological Genetics. Longman, " London. 1981. ...
  • E. Randi, V. Lucchini, "Organization and evolution of the mitochondrial ...
  • F. Barbanera, M. Guerrini, AA. Khan, P. Panayides, P. Hadjigerou, ...
  • G.E. Watson, "Sympatry in Palearctic Alectoris patridges, " Evolution 16, ...
  • J.C. Avise, _ Markers, Natural History and Ewolution, Chapman & ...
  • M. Wink, P. Heidrich, "Molecular systematic of owls based on ...
  • S.M. Scheiner, "Genetic and evolution of phenotypic plasticity, " Annual ...
  • نمایش کامل مراجع