ردیابی سرولوژیک ، مولکولی و بررسی تبارزایی ویروس موزاییک خیار جدا شده از گیاه اسفناج در یزد

ویروس موزاییک خیار عضو جنس Cucumovirus از خانوادهی Bromoviridae میباشد که دارای پیکرههای ایزومتریک و ژنوم RNA تک رشتهای و مثبت است. این ویروس یکی از مهمترین ویروسهای آلوده کنندهی گیاهان مختلف است و گستردهترین دامنهی میزبانی را در بین ویروسهای گیاهی دارد. در آذر ماه سال 94 نمونههایی از گیاه اسفناج طمن در قه محمد آباد یزد جمعآوری گردید. نمونههای جمعآوری شده توسط آزمون ELISA-DAS مورد بررسی قرار گرفتند. به منظور بررسی دقیقتر از روش -RTPCR استفاده شد. بدین منظور ابتدا استخراج RNA کل گیاه با استفاده از دستور کار kit isolation RNA Column ) شرکت دنازیست ایران) انجام شد و وجود آلودگی ویروسی با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن پروتیین پوششی بررسی شد. نتایج حاصل از آزمون الایزا وجود آلودگی به ویروس موزاییک خیار در نمونههای اسفناج را نشان داد. همچنین نتایج حاصل از آزمون PCR-RTنشان دهندهی وجود یک قطعهی 870 جفت بازی بود. محصول حاصل از PCR برای تعیین توالی به شرکت ماکروژن(کره جنوبی) فرستاده شد و پس از آن ترادف موجود با استفاده از برنامهی BLAST در پایگاه اطلاعاتی NCBI با ترادفهای موجود در GenBankمقایسه گردید. مقایسه توالی نوکلیوتیدی قطعه 870 جفت بازی در جدایه SpY) اسفناج) نشان داد این جدایه دارای 99 %شباهت با استرین wsj جدا شده از erecta Tagetes) گل جعفری) در چین است. آنالیز فیلوژنتیکی و رسم درخت فیلوژنی توسط نرم افزار 6 MEGA بر اساس روش likelihood Maximum انجام گرفت. نتایج این بررسی نشان داد جدایه SpY در کنار استرینهای زیر گروه II ویروس موزاییک خیار قرار گرفته است.

کلیدواژه ها:

ویروس موزاییک خیار ، اسفناج ، الایزا ، PCR-RT