همانطور که قبلا اعلام شده بود، سیستم بانک مقالات سیویلیکا در حال ارتقاء می باشد. در سیستم جدید که همزمان با آغاز سومین سال فعالیت سایت فاز اول آن به بهره برداری می رسد، کاربران می توانند جستجوی خود را بر اساس طبقه بندی علوم انجام داده و به نتایج دقیقتری برسند. تقسیم بندی علوم بر اساس مطالعات گسترده گروه توسعه سیویلیکا انجام پذیرفته است. علوم در جهان به چهار دسته علوم فیزیکی و مهندسی، علوم زیستی و کشاورزی، علوم اجتماعی و علوم سلامت (پزشکی) تقسیم بندی می شوند. در سیویلیکا نیز هر یک از سرشاخه های اصلی علوم بر اساس آخرین استانداردها، در دو سطح متفاوت دوباره طبقه بندی می شوند.

در حال حاضر برنامه نویسی ساختاری طبقه بندی علوم به اتمام رسیده و 24،000 مقاله موجود در حال تقسیم بندی و اختصاص طبقه های مورد نظر هستند.