رسول محمدی نجف ابادی - دانشجوی دکتری - گروه اصلاح و نباتات و بیوتکنولوژی - دانشکده کشاورزی - دان
بابک لطیف - دانشجوی دکتری - گروه اصلاح و نباتات و بیوتکنولوژی - دانشکده کشاورزی - دان

به منظور بهینه سازی تولید پروتئین در سیستمهای بیانی ، تحلیل الگوی کدون های مترادف و تعیین کدون های بهینه بسیار مهم است. در این راستا کلروپلاست به علت اندازه ژنوم کوچک و تعداد کپی برداری زیاد از اهمیت ویژه ای برخوردار است . از این رو پژوهش حاضر به تحلیل الگوی کدونهای منرادف و تعیین کدون های بهینه در کلروپلاست گیاه سویا با استفاده از روشهای چند متغیره اماری پرداخته است. نتایج حاصل از CAI و محور اول در انالیز تطبیقی 0/4 = r وجود داشت که نشان دهنده انحراف کدونی بیشتر در ژن های با سطح بیان بالاتر بود. در پزوهش حاضر به منظور شناسایی کدون های بهینه از دو انتهای محور اول در انالیز تظبیقی 10% از ژنها جداسازی شدند. سپس اختلاف کدونی بین این دو د سته زن با استفاده از ازمون کاپی اسکور مورد بررسی قرار گرفت. شناسایی کدون های برتر می تواند برای معرفی جهش های نقطه ای و تغییر زن ها به منظور افرایش تولید پروتئین در مهندسی ژنتیک کلروپلاست مفید و موثر باشد.

سویا ، کلروپلاست ، کدون مترادف ، کدون بهینه