بهناز دولت آبادی - دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبی
غلامعلی رنجبر - دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی
مسعود توحیدفر - دانشیار پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران
علی دهستانی کلاگر - استادیار پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان

تکنولوژی DNA نوترکیب امکان انتقال ژن از یک گونه به گونه هایی کاملا متفاوت را فراهم آورده است اما مسئله حائز اهمیت بیان مناسب این ژ نها در گونه گیرنده است. موجودات مختلف برای بیان ژ نها، کدون های خاصی را ترجیح م یدهند. کارایی فرآیند ترجمه از فراوانی کدو نهای بکار رفته در ژن تاثیر می پذیرد بنابراین برای رفع مشکلات کلون کردن ژ نها و انتقال آن ها از یک گونه به گونه ای غیرخویشاوند بهین هسازی کدونی امری ضروری است. برای تسریع و سهولت مبارزه شیمیایی با علف های هرز خانواده سولاناسه که از نظر ارزش غذایی و اقتصادی بسیار مورد توجه است ایجاد ارقام مقاوم به عل فکش راهکاری کاربردی است. آنزیم سیتوکروم 450 P سمیت عل فکش را در گیاه کاهش می دهد و گیاهان دارای این آنزیم م یتوانند سطح بالاتری از عل فکش را تحمل نمایند، بدین منظور توالی ژن کد کننده سیتوکروم 450 P از باکتری Sfreptomyces griseolus با شماره دست یابی 426708 AB از سایت (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)NCBI دریافت شد و با نرم افزار Vector NTI advance11 بهینه و سایر آنالیزها با نرم افزار DNAStar انجام شد. نتایج بدست آمده نشان داد درصد GC در توالی اولیه از 68 % به 39 % در توالی بهینه شده کاهش یافته است، که به دلیل تغییر در نوع کدونهای ترجیحی می باشد. مقایسه توالی منشا و توالی بهینه شده، تغییر در کدونهای ترجیحی، جایگاه شناسایی آنزیم های برشی و ترکیب بازها را نشان داد و در نهایت ترجمه هر دو توالی، مشخص شد هر دو توالی آمینو اسیدهای کاملا یکسانی را کد می کنند و بهینه سازی هیچ تغییری در نوع و ترتیب آمینو اسیدها به وجود نیاورده است.

بهینه سازی کدونی، سیتوکروم 450 P ، سولاناسه