ابراهیم ترکتاز - گروه بیوتکنولوژی دانشکده علوم و فناوری های نوین دانشگاه اصفهان
رضا کربلایی - کمیته پژوهشی دانشجویان دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی

جنس بسیار گرما دوست در بین خانواده Thermococcaceae می باشدکه باکتری های متعلق به این جنس در دمای بالای70°C زندگیکرده و آنزیم هایی بسیار گرمادوست را تولید می کنند. از جمله آنزیم هایبسیار گرما دوست تولید شده توسط باکتریهای این جنس آمیلاز می باشد که درصنعت بسیار پرکاربرد می باشد.امروزه هیدرولیز نشاسته یکی از صنعت های مهمی است که آمیلاز می تواند نقش کلیدی در تغییر فرآیند آن از فرآیندصنعتی به زیستی ایفا کن د. با توجه به ضرورت وجود دمای بالا( بیش از85°C ) برای هیدرولیز نشاسته، فرم عادی آمیلاز که به وسیله نوعوحشیThermococcusتولید می شود، کارکرد صنعتی ندارد. در این مطالعه به منظور افزایش پایداری دمایی آمیلاز در جهت رسیدن به نوع صنعتی نوین وبهینه جدید، از روش in silico برای مدل سازی استفاده شد. مدل سه بعدی مربوط به آمیلازThermococcus بوسیله الگوریتمHidden Markov Model پیش بینی شد. سپس مدل پیش بینی شده به عنوان الگو برای الگوریتم PopMusicمورد استفاده قرار گرفت. با استفاده از جهش هدفمند، تغییر درهر جایگاه از جنبه پایداری دمایی اندازه گیری شد. بر اساس خروجی الگوریتم PopMusic، بهترین موقعیت های جایگزینی شامل موارد زیر می باشند : 36Q به E و 338 D بهH به ترتیب با افزایش 49.6-و 40.6-در پایداری دمایی در ابعادDDG و 147 Dب هE با تغییر65.01- در ابعادDDG .این مطالعهپیشنهاد می کند که این جهش های نقطه ای می توانند جهت اهداف آزمایشگاهی با دقت قابل اتکا استفاده شوند.

پایداری دمایی، مدل سازی In silico، آمیلاز ،Thermococcus