CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی شبکه هم بیانی ژنSOS1 با استفاده ازGeneCAT

عنوان مقاله: بررسی شبکه هم بیانی ژنSOS1 با استفاده ازGeneCAT
شناسه ملی مقاله: CIGS13_1265
منتشر شده در اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران در سال 1393
مشخصات نویسندگان مقاله:

فریبا قادری - دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات
فرانگیز قادری - دانشیارگروه اصلاح و بیوتکنولوژی دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سیروان سعیدی آذر - دانشیارگروه اصلاح و بیوتکنولوژی دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سیدکمال کاظمی تبار - دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات

خلاصه مقاله:
ژن ها در یک مسیر زیستی اغلب به صورت جمعی بیان می شوند و ینابراین اطلاعاتی در مورد هم بیانی کلیدی جهت درک سیستم های بیولوژیکی است. تجزیه ریزآرایهDNAاطلاعاتی را در مورد بیان نسبی هزاران ژن به طور همزمان تولید می کند. چنین داده های ریزماهواره ای در مخزن هایی جمع آوری شده استGeneCAT.یک جعبه ابزار آنالیز هم بیانی ژن است که دربردارنده چندین ابزارجدید تجزیه کننده اطلاعات ریزآرایه است. در آرابیدوپسیس تالیانا، جایگاه ژنSOS1برای تعادل یون سدیم و پتاسیم مهم میباشد و این ژن در محیط به بازدارندگی رشدی از طریق بالارفتن سدیم و پایین آمدن پتاسیم حساس است. هدف از این مطالعه بررسی شبکه همبیانی ژنSOS1 در گیاه آرابیدوپسیس و همچنین میزان بیان این ژنها در مراحل مختلف رشد و بررسی عناصر تنظیمی ژنSOS1 میباشد. نتایج نشان داد از لحاظ روابط فیلوژنتیکی ژنSOS1با ژن با شناسهAt1g34400روابط خویشاوندی نزدیکی دارد و درنتیجه بیشترین میزان همبستگی را دارند. هم چنین دو عنصر تنظیمیG-Box و ABREاین ژن را تنظیم میکنند. و بیشترین میزان بیان این ژن در مراحل ریشه ای، گیاهچهای و تشکیل بذر بوده است. این نتایج اطلاعاتی را در اختیار قرار می دهد تا مسیرهای پیچیده در واکنش به تنش را بهتر بررسی کنیم

کلمات کلیدی:
شبکه هم بیانی، بیان ژن، ژنSOS1 ، آرابیدوپسیس

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/328922/