بازسازی و تجزیه و تحلیل شبکه ژنی تحمل به خشکی در مرحله جوانی زنی گیاه خلر Lathyrus sativus L

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CBGCONF03_064

تاریخ نمایه سازی: 8 آبان 1395

چکیده مقاله:

خلر با نام علمی Lathyrus sativus L. یکی از گیاهان علوفه ای خانواده بقولات است که در پیشینه کشاورزی مناطق مختلف ایران سابقه ای طولانی دارد. تنش خشکی یکی از عوامل مهم محدودکنده در مراحل حساس گیاه از جمله مرحله جوانه زنی می باشد که موجب کاهش رشد اولیه و سریع این گیاه می شود. بدلیل پیچیدگی و چند ژنی بودن صفت تحمل به خشکی در این تحقیق سعی شدهاست تا با گرداوری تمامی ژنها شناخته شده دخیل در تحمل به خشکی در مرحله جوانه زنی گیاه خلرف شبکه ژنی درگیر، بازسازی شده و تصویر روشنتری از نحوه پاسخ دهی گیاه خلر در این مرحله حساس به تنش خشکی و ژنهای کلیدی مربوطه حاصل شود از مجموعه 49 ژن شناسایی شده، 20 ژن به عنوان موثرترین ژنها شناخت و شبکه ژنی مربوط به آن ترسیم شد. نتایج نشان داد که از لحاظ فرایندهای بیولوژیکی ژنهای موثر از گروه اول اجزای مسی رانتقال پیام مانند CIPK15 گجروه دوم از عوامل رونویسی شامل DREB1A و AZF2 و گروه سوم در برگیرنده ژنهای به رمز درآورنده پروتئینهای کارکردی همانند Dehydrin COR47 و Chaperone protein ClpC1 بیشترین تاثیر را در تحمل به خشکی در مرحله جوانه زنی گیاه خلذ دارند. امید است نتایج به دست آمده در راستای یافتن راهکارهایی هدفمند جهت افزایش تحمل به خشکی مفید واقع گردد.

کلیدواژه ها:

گیاه خلر Lathyrus sativus L ، مرحله جوانه زنی ، تنش خشکی ، شبکه ژنی Pathway Studio ، Cytoscape

نویسندگان

سیده مهری جوادی

عضو هیئت علمی گروه پژوهشی فیزیولوژی و ژنتیک گیاهی پژوهشکده علوم پایه کاربردی جهاد دانشگاهی دانشگاه شهید بهشتی اوین، تهران

میترا پارسا

عضو هیئت علمی گروه پژوهشی فیزیولوژی و ژنتیک گیاهی پژوهشکده علوم پایه کاربردی جهاد دانشگاهی دانشگاه شهید بهشتی اوین، تهران

امینه زینالی

عضو هیئت علمی گروه پژوهشی فیزیولوژی و ژنتیک گیاهی پژوهشکده علوم پایه کاربردی جهاد دانشگاهی دانشگاه شهید بهشتی اوین، تهران

مرجان روشنفکر راد

عضو هیئت علمی گروه پژوهشی فیزیولوژی و ژنتیک گیاهی پژوهشکده علوم پایه کاربردی جهاد دانشگاهی دانشگاه شهید بهشتی اوین، تهران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Altschul, S.F., et al., Basic local alignment search tool. Journal ...
  • Altschul, S.F., et al., Gapped BLAST and PSI-BLAST: a neww ...
  • Nikitin, A., et al., Pathway studio-the analysis and navigation of ...
  • Smoot, M.E., et al., Cytoscape 2.8: new features for data ...
  • Xiang, Y., Y. Huang, and L. Xiong, Characteriza tion of ...
  • Agarwal Pradeep K, A.P., Reddy M .K , Sopory Sudhir ...
  • Sakuma, Y., _ al., DNA-binding specificity of the ERF/AP2 domain ...
  • C O mmunications _ 2002. 290(3): p. 998-1009. ...
  • Xiong, Y. and S.-Z. Fei, Functional and phylogenetic analysis of ...
  • Liu, Q., et al., Two transcription factors, DREB1 and DREB2, ...
  • pathways in drought-and low- temp era tu re-responsive gene expression, ...
  • Badawi, M., et al., The CBF gene family in hexaploid ...
  • Battaglia, M., et al., The enigmatic LEA proteins and other ...
  • نمایش کامل مراجع