شناسایی متغیرهای مهم در ژنوتیپ های یک و دو ویروس هپاتیت سی با استفاده از الگوریتم های آماری وزن دهی

ویروس هپاتیت سیHCV یکی از مهمترین علل عفونی تهدید کننده سلامتی در سراسر جهان است که نوع درمان و طول درمان وهزینه های درمان هپاتیتC بستگی به ژنوتیپ ویروس دارد از این جهت تعیین وشناسایی نوع ژنوتیپ از اهمیت بالایی برخوردار هست. این مطالعه از الگوریتم های مختلف وزن دهی به منظور شناسایی متغیر های مهم نوکلئوتیدی در بین ژنوتیپ های یک و دو ویروسهپاتیت سی انجام شده است. دیتابیس اولیه که داری 78 ویژگی است و با تمیزکردن به 23 تا کاهش می یابد. که با اجرای 10 الگوریتم روی آن به 10 دیتابیس دیگر دست پیدا کردیم که یکی از آنها درخت تصمیم با تعدادی ویژگی است. نتایج حاصله نشان داد که اسید آمینهگوانین به تنهایی یا در ترکیب با سیتوزین به عنوان مهمترین متغیرهای ژنی جهت تمایز ژنوتیپ های یک و دو ویروس هپاتیت سیمشخص گردیده است. فراونی گوآنین (حداکثر آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 0,29 و 0,285 و میانگین آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 0,28 و 0,27 ) و فراوانی سیتوزین -گوآنین (حداکثر آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 0,068 و 0,063 و میانگین آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 0,063 و 0,055 ) و تعداد سیتوزین-گوآنین (حداکثر آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 927 و 730 و میانگین آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 592,8و 529,3 ) به عنوان مهم ترین عوامل در تفاوت ساختاری ژنوتیپ های یک و دو شناسایی شدند. برای اولین بار نشان داده شد که فراوانی گوانین می تواند به عنوان یک شاخص مهم در شناسایی دو ژنوتیپ ویروس هپاتیت سی مورد استفاده قرار گیرد

کلیدواژه ها:

داده کاوی ، هپاتیت سی ، ژنوتیپ 1و 2 ، وزن دهی صفات