بررسی ساختار ژنی و پراکنش ژنهای WD40 بر روی کروموزومهای گیاه آفتابگردان

خانواده فاکتور رونوشت برداریWD40 نقش مهمی در پاسخ به تنشهای غیر زیستی ایفا میکند. این پژوهش منجر به شناسایی266 ژن WD40 در گیاه آفتابگردان گردید. توالی های CDS و توالی های ژنومیک از پایگاه اطلاعاتی helia gene استخراج گردید. سپس موقعیت اینترونها و اگزونهای هر کدام از ژنهای WD40 نیز با استفاده از پایگاه اطلاعاتی gsds مشخص شد. همچنین با استفاده از پایگاه اطلاعاتی helia gene اطلاعات مربوط به موقعیت فیزیکی هر کدام از ژنها شامل طول ژن، نقطه شروع و نقطه پایان ژن تعیین شد. با استفاده از اطلاعات حاصل به کمک نرم افزار Mapchart موقعیت فیزیکی هر کدام از ژن ها بر روی کرو موزومهای آفتابگردان به صورت گرافیکی به نمایش در آمد. نتایج حاصل از واکاوی نشان داد که کروموزوم 4 دارای بیشترین تعداد ژن WD40 و کروموزوم 7 دارای کمترین تعداد ژن WD40 می باشد.

کلیدواژه ها:

فاکتور رونویسی ، WD40 ، آفتابگردان ، پراکنش ژنها ، ساختار ژنی