کاربرد نشانگر مولکولیAFLP در انگشت نگاری ژنتیکی اکوتیپ های برنج استان مازندران

تهیه الگوی انگشت نگاری DNA ارقام مختلف در پیشبرد برنامه های اصلاحی مانند گزینش و تایید هیبرید تاثیر بسزایی دارد و علاوه بر این می تواند در حفظ گونه های بومی موثر واقع شود. نشانگرهای مولکولی AFLPبه دلیل سرعت، دقت، پوشش بالای ژنوم و نیز ارایه نتایج قابل اعتماد و تکرارپذیری بالا، قابلیت زیادی در انگشت نگاری ژنتیکی دارند. در این پژوهش، به منظور انگشت نگاری و ارزیابی برنج بومی استان مازندران، تعداد 48 اکوتیپ برنج با استفاده از 6 ترکیب آغازگری (EcoRI/ TruII) مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج حاصل از آنالیز داده ها نشان داد، درمجموع 220 باند امتیازدهی شد که از میان آنها 213 (8/96٪) باند چندشکل بودند، که این نشان دهنده درصد بالای چندشکلی در بین اکوتیپ های مورد مطالعه بود. از میان آغازگرهای مورد استفاده ترکیب آغازگری M-CAC وE-TTG با 50 باند بیشترین تعداد باند و ترکیب آغازگری E-ACGو M-CCC با 20 باند کمترین تعداد باند را تولید کردند. میانگین اطلاعات چند شکلی (PIC) مقدار عددی 22/0 را نشان داد. شاخص نشانگر (MI) در هر ترکیب آغازگر محاسبه شد که میزان آن از 34/14تا 06/31 متغیر بود. ترکیب آغازگری E-CAA و M-CAC با درصد چندشکلی (100٪)، بیشترین ضریب شانون (37/0)، بیشترین میزان PIC (31/0) و همچنین بیشترین شاخص نشانگری (06/31) را به خود اختصاص داد. در نتیجه این ترکیب آغازگری برترین ترکیب جهت تفکیک و تمایز اکوتیپ های برنج مورد مطالعه تشخیص داده شد. همچنین نتایج حاکی از کارآیی مناسب نشانگر AFLPدر ارزیابی تنوع ژنتیکی، شناسایی و تمایز اکوتیپ های بومی برنج می باشند.

کلیدواژه ها:

انگشت نگاری ژنتیکی ، برنج ، نشانگر AFLP ، چندشکلی