ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام برنج با استفاده از نشانگر RAPD وتجزیه کلاستر

تعیین سطح تنوع ژنتیکی و روابط بین ژنوتیپها اساس شناسایی والدین مناسب برای اهداف اصلاحی مختلف بشمار میرود. در این راستا نشانگرهای مولکولی به طور موفقیت آمیز در ارزیابی تنوع ژنتیکی انواع گیاهان زراعی مورد استفاده قرار گرفته اند. در این آزمایش تنوع ژنتیکی 8 رقم برنج با استفاده از 10 آغازگر RAPD مورد بررسی قرار گرفت. ارقام مورد استفاده در این آزمایش عبارت بودند از -1 دمسیاه. -2طارم صمدی. -3شیرودی.-4 فجر آهنگرمحله. -5 امان اللهی. -6 سنگ طارم. -7 طارم هاشمی. -8 فجر 70 روزه. محاسبه ماتریس مشابهت و تجزیه خوشه ای با استفاده از نرم افزار NTSYS انجام شد. بر اساس نتایج این آزمایش از بین 10 پرایمر استفاده شده، 8 پرایمر توانستند چندشکلی را در میان ژنوتیپ ها ایجاد نمایند. این آغازگرها در کل 8 ژنوتیپ، 271 باند تولید کردند که از 63 مکان ژنی تکثیر شده؛ هر63 مکان دارای چند شکلی بودند. دامنه حاوی چندشکلی 60 درصد و چندشکلی 100 درصد در بین پرایمرها بود. در بین 8 پرایمر حاوی چند شکلی، بیشترین چند شکلی مربوط به پرایمرهای opg9 ,opg2 ,opg1 بوده است. در بین آغازگرهای چند شکل، بیشترین مکان چندشکل مربوط به آغازگر opg1 بوده است. نتایج تجزیه کلاستر نشان داد در میان کلونی های مورد مطالعه تغییرات تشابه از مقدار 0/47 تا 0/72بود که نشان از تنوع نسبتا 0 بالا در میان کلونیهای جمع آوری شده داشت. نزدیکترین ژنوتیپها در بررسی حاضر ژنوتیپ های فجرآهنگرمحله و شیرودی با ضریب تشابه 0/72 و دورترین آنها دمسیاه و طارم هاشمی بودند که تشابهی برابر 0/47 داشتند

کلیدواژه ها:

برنج ، نشانگر مولکولی ، تجزیه کلاستر ، رقم