شناسایی in silico خانواده ژنی PLD و بررسی الگوی بیان آنها در پاسخ به تنش شوری در گیاه Medicago truncatula

فسفولیپاز (PLD) D و اسید فسفاتیک حاصل از آن نقش مهمی در تنظیم فرآیندهای سلولی از جمله رشد و نمو و پاسخ به تنش دارد. PLD ها یک خانواده ژنی مهم را در گیاهان عالی تشکیل می دهند. که در آرابیدوپسیس، برنج و پنبه شناسایی شده اند . در این پژوهش 16 ژن PLD در گیاه Medicago truncatula L. شناسایی شد که براساس دمین های پروتیینی، روابط فیلوژنی، ساختار ژن و شباهت توالی به 6 گروه α (4 ژن)، β(2 ژن)، γ(3 ژن)، δ(3 ژن)، ε(2 ژن)، ζ(2 ژن)، φ(1 ژن) تقسیم شد. الگوی بیان ژن های MtPLD4 و MtPLD9 در زیرگروه α و ژن های MtPLD13 و MtPLD15 در زیر گروه γ /β تحت تنش شوری NaCl با غلظت 23ds/m در گیاهچه های چهار هفته ای M. truncatula L. با استفاده از qRT-PCR بررسی شد. بیان MtPLD4 در طی 48 ساعت نسبت به گیاه شاهد به طور معنی داری افزایش داشت. الگوی بیان MtPLD9 و MtPLD15 در ساعات اولیه روند افزایشی و سپس نسبت به گیاه شاهد کاهش بیان داشت. بیان MtPLD13 در طی 48 ساعت کاملا روند کاهشی داشته و سرکوب شد. این نتایج نشان داد که زیرگروه α ژن های MtPLD کاندیدای مهم و با ارزشی جهت آزمون های بعدی و مطالعات ژنومیکس کارکردی است.

کلیدواژه ها:

اسید فسفاتیک ، تنش شوری ، فسفولیپاز ، Medicago truncatula ، qRT-PCR