CIVILICA We Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

Systems Biology Analysis of the Key Genes of Surfactin Production in Bacillus subtilis MJ01 (Isolated from Soil Contaminated Oil in South of Iran), Spizizenii, and 168 Isolates

اعتبار موردنیاز : ۱ | تعداد صفحات: ۱۴ | تعداد نمایش خلاصه: ۹ | نظرات: ۰
سال انتشار: ۱۳۹۶
کد COI مقاله: JR_JCMR-9-2_006
زبان مقاله: انگلیسی
حجم فایل: ۴۹۲.۵۹ کیلوبایت (فایل این مقاله در ۱۴ صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد)

راهنمای دانلود فایل کامل این مقاله

اگر در مجموعه سیویلیکا عضو نیستید، به راحتی می توانید از طریق فرم روبرو اصل این مقاله را خریداری نمایید.
با عضویت در سیویلیکا می توانید اصل مقالات را با حداقل ۳۳ درصد تخفیف (دو سوم قیمت خرید تک مقاله) دریافت نمایید. برای عضویت در سیویلیکا به صفحه ثبت نام مراجعه نمایید. در صورتی که دارای نام کاربری در مجموعه سیویلیکا هستید، ابتدا از قسمت بالای صفحه با نام کاربری خود وارد شده و سپس به این صفحه مراجعه نمایید.
لطفا قبل از اقدام به خرید اینترنتی این مقاله، ابتدا تعداد صفحات مقاله را در بالای این صفحه کنترل نمایید.
برای راهنمایی کاملتر راهنمای سایت را مطالعه کنید.

خرید و دانلود فایل مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای ۱۴ صفحه است در اختیار داشته باشید.

قیمت این مقاله : ۳,۰۰۰ تومان

آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله Systems Biology Analysis of the Key Genes of Surfactin Production in Bacillus subtilis MJ01 (Isolated from Soil Contaminated Oil in South of Iran), Spizizenii, and 168 Isolates

Tahereh Deihimi - Institute of Biotechnology, Shiraz University, Shiraz, Iran
Esmaeil Ebrahimie - Institute of Biotechnology, Shiraz University, Shiraz, Iran- Adelaide Medical School, Faculty of Health and Medical Sciences, The University of Adelaide, Adelaide, Australia
Ali Niazi - Institute of Biotechnology, Shiraz University, Shiraz, Iran
  Mansour Ebrahimie - Department of Biology, University of Qom, Qom, Iran
  Shahab Ayatollahi - School of Chemical & Petroleum Engineering, Sharif University of Technology, Tehran, Iran
  Ahmad Tahmasebi - Department of Crop Production & Plant Breeding, College of Agriculture, Shiraz University, Shiraz, Iran

چکیده مقاله:

Applying microorganism in oil recovery has attracted attentions recently. Surfactin produced by Bacillus subtilis is widely used industrially in a range of industrial applications in pharmecutical and environmental sectors. Little information about molecular mechanism of suffactin compound is available. In this study, we performed promoter and network analysis of surfactin production genes in Bacillus subtilis subsp. MJ01 (isolated from oil contaminated soil in South of Iran), spizizenii and 168. Our analysis revealed that comQ and comX are the genes with sequencealterations among these three strains of Bacillus subtilis and are involved in surfactin production. Promoter analysis indicated that lrp, argR, rpoD, purr and ihf are overrepresented and have the highest number of transcription factor binding sites (TFBs) on the key surfactin production genes in all 3 strains. Also the pattern of TFBs among these three strains was completely different. Interestingly, there is distinct difference between 168, spizizenii and MJ01 in their frequency of TFs that activate genes involve in surfactin production. Attribute weighting algorithms and decision tree analysis revealed ihf, rpoD and flHCD as the most important TF among surfactin production. Network analysis identified two significant network modules. The first one consists of key genes involved in surfactin production and the second module includes key TFs, involved in regulation of surfactin production. Our findings enhance understanding the molecular mechanism of surfactin production through systems biology analysis.

کلیدواژه‌ها:

Surfactin production gene, Transcription factor (TF), Promoter analysis, Network analysis

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:
https://www.civilica.com/Paper-JR_JCMR-JR_JCMR-9-2_006.html
کد COI مقاله: JR_JCMR-9-2_006

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Deihimi, Tahereh; Esmaeil Ebrahimie; Ali Niazi; Mansour Ebrahimie; Shahab Ayatollahi & Ahmad Tahmasebi, ۱۳۹۶, Systems Biology Analysis of the Key Genes of Surfactin Production in Bacillus subtilis MJ01 (Isolated from Soil Contaminated Oil in South of Iran), Spizizenii, and 168 Isolates, Journal of Cell and Molecular Research 9 (2), https://www.civilica.com/Paper-JR_JCMR-JR_JCMR-9-2_006.html

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (Deihimi, Tahereh; Esmaeil Ebrahimie; Ali Niazi; Mansour Ebrahimie; Shahab Ayatollahi & Ahmad Tahmasebi, ۱۳۹۶)
برای بار دوم به بعد: (Deihimi; Ebrahimie; Niazi; Ebrahimie; Ayatollahi & Tahmasebi, ۱۳۹۶)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

شبکه تبلیغات علمی کشور

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.