بهینه سازی توالی کدکننده فاکتور رشد فیبروبلاستی بازی انسانی بمنظور بیان در گیاه برنج و همسانه سازی آن تحت کنترل توالی های تنظیم کننده ژن ramy3D در ناقل دوتایی pCAMBIA1304

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 385

فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-10-1_001

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

چکیده مقاله:

فاکتور رشد فیبروبلاستی بازی انسانی (bFGF) یک پروتئین بسیار با ارزش با کاربردهای گسترده درمانی و تحقیقاتی است. در حال حاضر تولید این فاکتور رشد بشکل نوترکیب در بسترهای مرسوم میکروبی و سلول­های حشرات با مشکلاتی همراه است که منجر به هزینه تولید بالا و در نتیجه محدود ساختن کاربرد آن شده است. کشت سلولی گیاه برنج بستری کارامد، ایمن و کم هزینه برای تولید پروتئین­ نوترکیب است. هدف از این تحقیق تهیه یک سازه بیانی مناسب برای بیان بالای نسخه بهینه سازی شده­ای از فاکتور رشد انسانی bFGF در کشت سلولی گیاه برنج تحت کنترل عوامل تنظیمی ژن ramy3D بوده است. برای این منظور ابتدا توالی کدکننده فاکتور bFGF بر اساس شاخص­های کاربرد کدونی و محتوای GC برای بیان در گیاه برنج بهینه سازی و در ادامه سنتز شد. بدنبال فرایند بهینه سازی، شاخص سازگاری کدونی از 76/0 به 82/0 و محتوای GC از 65/52 درصد به 45/55 درصد ارتقا یافت. توالی­های تنظیم کننده ژن ramy3D برنج در قالب دو قطعه مجزا از روی DNA ژنومی تکثیر و همسانه سازی شدند. در ادامه اقدام به سرهم سازی توالی­های تنظیم کننده ژن ramy3D در ناقل دوتایی گیاهی pCAMBIA1304 و سپس درج توالی کدکننده بهینه سازی شده­ی bFGF در حدفاصل توالی پپتید راهنما و 3′UTR شد. از جمله مزیت­های سیستم بیانی Ramy3D می­توان به میزان بیان بالای ژن انتقالی، القاپذیر بودن و همچنین سهولت تخلیص پروتئین بواسطه ترشح به محیط اشاره کرد.

نویسندگان

میثم بسطامی

دانشجوی دکتری، گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره)، قزوین، ایران.

رامین حسینی

دانشیار، گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره)، قزوین. ایران.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • An N, Ou J, Jiang D, Zhang L, Liu J, ...
  • Bikfalvi A, Klein S, Pintucci G, Rifkin DB (1997). Biological ...
  • Bimboim H, Doly J (1979). A rapid alkaline extraction procedure ...
  • Böhlen P, Baird A, Esch F, Ling N, Gospodarowicz D ...
  • Chen R, John J, Lavrentieva A, Müller S, Tomala M, ...
  • Chung C, Niemela SL, Miller RH (1989). One-step preparation of ...
  • Delrieu I (2000). The high molecular weight isoforms of basic ...
  • Ding S-H, Huang L-Y, Wang Y-D, Sun H-C, Xiang Z-H ...
  • Doyle JJ (1987). A rapid DNA isolation procedure for small ...
  • Fernig DG, Gallagher JT (1994). Fibroblast growth factors and their ...
  • Gasparian M, Elistratov P, Drize N, Nifontova I, Dolgikh D, ...
  • Gospodarowicz D, Bialecki H, Greenburg G (1978). Purification of the ...
  • Gospodarowicz D, Neufeld G, Schweigerer L (1986). Molecular and biological ...
  • Gould N, Hendy O, Papamichail D (2014). Computational tools and ...
  • Hellwig S, Drossard J, Twyman RM, Fischer R (2004). Plant ...
  • Hiei Y, Komari T (2008). Agrobacterium-mediated transformation of rice using ...
  • Huang L-F, Tan C-C, Yeh J-F, Liu H-Y, Liu Y-K, ...
  • Huang N, Chandler J, Thomas BR, Koizumi N, Rodriguez RL ...
  • Jackson MA, Sternes PR, Mudge SR, Graham MW, Birch RG ...
  • Ke Y, Wilkinson MC, Fernig DG, Smith JA, Rudland PS, ...
  • Kirchhoff J, Raven N, Boes A, Roberts JL, Russell S, ...
  • Kwong KW, Ng KL, Lam C-C, Wang YY, Wong W ...
  • Liu X, Zhu X (1998). Basic fibroblast growth factor protected ...
  • Mozhgan S, Abdolreza B, Mokhtar J, Alireza S, Mahdi B, ...
  • Mu X, Kong N, Chen W, Zhang T, Shen M, ...
  • Nishimura A, Aichi I, Matsuoka M (2006). A protocol for ...
  • Saber AZ, Khadijeh B, Mokhtar JJ, Fereydoun M (2015). Expression ...
  • Sharp PM, Li W-H (1987). The codon adaptation index-a measure ...
  • Shin YJ, Hong SY, Kwon TH, Jang YS, Yang MS ...
  • Ullrich KK, Hiss M, Rensing SA (2015). Means to optimize ...
  • Wang K (2006) Agrobacterium protocols, vol 1. Springer ...
  • Wang Y-P, Wei Z-Y, Zhong X-F, Lin C-J, Cai Y-H, ...
  • Wilmink A, Dons J (1993). Selective agents and marker genes ...
  • Wu X, Kamei K, Sato H, Sato S-i, Takano R, ...
  • Xu J, Ge X, Dolan MC (2011). Towards high-yield production ...
  • نمایش کامل مراجع