CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)
عنوان
مقاله

شناسایی نشانگرهای بیوشیمیایی برتر مرتبط با تحمل به شوری در گندم با استفاده از داده-کاوی

اعتبار موردنیاز PDF: ۱ | تعداد صفحات: ۲۰ | تعداد نمایش خلاصه: ۱۷ | نظرات: ۰
سال انتشار: ۱۳۹۷
کد COI مقاله: JR_JOAGK-10-4_004
زبان مقاله: فارسی
حجم فایل: ۶۴۷.۹۷ کیلوبایت (فایل این مقاله در ۲۰ صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد)

راهنمای دانلود فایل کامل این مقاله

متن کامل این مقاله دارای ۲۰ صفحه در فرمت PDF قابل خریداری است. شما می توانید از طریق بخش روبرو فایل PDF این مقاله را با پرداخت اینترنتی ۳,۰۰۰ تومان بلافاصله دریافت فرمایید
قبل از اقدام به دریافت یا خرید مقاله، حتما به فرمت مقاله و تعداد صفحات مقاله دقت کامل را مبذول فرمایید.
علاوه بر خرید تک مقاله، می توانید با عضویت در سیویلیکا مقالات را به صورت اعتباری دریافت و ۲۰ تا ۳۰ درصد کمتر برای دریافت مقالات بپردازید. اعضای سیویلیکا می توانند صفحات تخصصی شخصی روی این مجموعه ایجاد نمایند.
برای راهنمایی کاملتر راهنمای سایت را مطالعه کنید.

خرید و دانلود فایل PDF مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای ۲۰ صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله شناسایی نشانگرهای بیوشیمیایی برتر مرتبط با تحمل به شوری در گندم با استفاده از داده-کاوی

  زهرا زینتی - استادیار، بخش اگرواکولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی داراب، دانشگاه شیراز، ایران
  عباس عالم زاده - نویسنده مسئول، دانشیار، بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، ایران

چکیده مقاله:

هدف: شناسایی مسیرهای موثر در ایجاد تحمل نسبت به تنش شوری یکی از مباحث جذاب در علوم گیاهی است که در این راستا روش­های جدید داده­کاوی نگرش جدیدی برای محققان ایجاد کرده است. در این پژوهش، الگوریتم­های انتخاب ویژگی (feature selection) و درخت تصمیم­گیری (decision tree, DT) به منظور شناسایی نشانگرهای بیوشیمیایی در تحمل به شوری استفاده شد.  مواد و روش­ها: در این راستا، به منظور بررسی برخی نشانگرهای بیوشیمیایی از جمله میزان پروتئین، آنزیم­های آنتی­اکسیدانی سوپراکسید دیسموتاز، پراکسیداز، کاتالاز، آسکوربات پراکسیداز، پرولین، میزان سدیم و پتاسیم در ارقام گندم و خویشاوند وحشی آنAegilops crassa ، آزمایشی به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تکرار انجام شد. فاکتورهای آزمایشی شامل ژنوتیپ (ارقام گندم زراعی ارگ (مقاوم به شوری) و الموت (حساس به شوری)، و یک خویشاوند وحشی (Ae. crassa)) و تنش شوری (کلرید سدیم  mM150 و mM 0) بودند. نتایج: نتایج این دو راهکار نشان داد که ترکیب سلسله مراتبی پرولین، سوپراکسید دیسموتاز و آسکوربات پراکسیداز می­تواند به عنوان نشانگرهای بیوشیمیایی برای انتخاب ژنوتیپ متحمل به تنش شوری استفاده گردد. دو درخت تصمیم­گیری دارای بیشترین کارایی در پیش­بینی ژنوتیپ حساس و متحمل بودند. این درخت­های تصمیم­گیری عبارت بودند از مدل درخت تصمیم­گیری Ratio DT Parallel Gain با کارایی 5/97 درصد که روی پایگاه داده­ای Info Gain Ratio اجرا شد و دیگری DT Gain Ratio با کارایی 67/91 درصد که روی پایگاه داده­ای  Ruleاجرا شد. نتیجه گیری: در مجموع، نتایج حاصله بیانگر آن بود که تلفیق مطالعات بیوانفورماتیک و آزمایشگاهی می­تواند منجر به شناسایی مسیرهای مرتبط با تنش شوری و فهم بهتر مکانیسم­های کنترل کننده تحمل به تنش شود.

کلیدواژه‌ها:

انتخاب ویژگی, درخت تصمیم گیری, گندم, نشانگرهای بیوشیمیایی

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:
https://www.civilica.com/Paper-JR_JOAGK-JR_JOAGK-10-4_004.html
کد COI مقاله: JR_JOAGK-10-4_004

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
زینتی, زهرا و عباس عالم زاده، ۱۳۹۷، شناسایی نشانگرهای بیوشیمیایی برتر مرتبط با تحمل به شوری در گندم با استفاده از داده-کاوی، دوفصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی 10 (4)، https://www.civilica.com/Paper-JR_JOAGK-JR_JOAGK-10-4_004.html

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (زینتی, زهرا و عباس عالم زاده، ۱۳۹۷)
برای بار دوم به بعد: (زینتی و عالم زاده، ۱۳۹۷)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

  • Bates LS, Waldren RP, Teare ID (1973) Rapid determination of ...
  • Becana M, Moran JF, Iturbe-Ormaetxe I (1998) Iron-dependent oxygen free ...
  • Beiki AH, Saboor S, Ebrahimi M (2012) A new avenue ...
  • Bekkerman R, El-Yaniv R, Tishby N, Winter Y (2003) Distributional ...
  • Bradford MM (1976) A rapid and sensitive method for the ...
  • Bradley AP (1997) The use of the area under the ...
  • Cadenas E (1989) Biochemistry of oxygen toxicity. Annu Rev Biochem ...
  • Chance B, Maehly AC (1954) Assay of catalase and peroxidase. ...
  • Dhindsa RS, Plumb-Dhindsa P, Thorpe TA (1981) Leaf senescence: correlated ...
  • Ebrahimi M, Ebrahimie E, Ebrahimi M (2009) Searching for patterns ...
  • Ebrahimie E, Ebrahimi M, Sarvestani NR (2011) Protein attributes contribute ...
  • Egneus H, HeberU, MatthiesenU, KirkM (1975) Reduction of oxygen by ...
  • Fridovich I (1986) Biological effects of the superoxide radical. Arch ...
  • Goudarzi M, Pakniyat H (2008) Evaluation of wheat cultivars under ...
  • Hammann F, Gutmann H, Jecklin U et al. (2009) Development ...
  • Hosseinzadeh F, Ebrahimi M, Goliaei B, Shamabadi N (2012) Classification ...
  • Kerepesi I, Galiba G (2000) Osmotic and salt stress-induced alteration ...
  • Kishor PK, Sangam S, Amrutha R et al. (2005) Regulation ...
  • Nakano Y, AsadaK (1981) Hydrogen peroxide is scavenged by ascorbate-specific ...
  • Nasiri J, Naghavi MR, Kayvanjoo AH et al. (2015) Precision ...
  • Reddy AR, Chaitanya KV, Vivekanandan M (2004) Drought-induced responses of ...
  • Sahi C, Singh A, Blumwald E,Grover A (2006) Beyond osmolytes ...
  • Szabados L, Savoure A (2010) Proline: a multifunctional amino acid. ...
  • Thapa G, Dey M, Sahoo L, Panda S (2011) An ...
  • Vinocur B, AltmanA (2005) Recent advances in engineering plant tolerance ...
  • Wang S, Wan C, Wang Y et al. (2004) The ...
  • Weston J, Elisseeff A, Schlkopf B, Tipping M (2003) Use ...
  • Zhu JK (2000) Genetic analysis of plant salt tolerance using ...
  • Zinati Z, Zamansani F, KayvanJoo Ah et al. (2014) New ...
  • Zinati Z, Alemzadeh A, KayvanJoo AH (2016) Computational approaches for ...
  • Iqbal N, Umar S, Khan NA, Khan MIR (2014) A ...
  • Kaur G, Asthir B (2015) Proline: a key player in ...
  • Reddy PS, Jogeswar G, Rasineni GK et al. (2015) Proline ...
  • Naliwajski MR, Skłodowska M (2014) Proline and its metabolism enzymes ...
  • Pioter Grazyana K (2005) Antioxidant defence in leaves of C3 ...
  • Bollivar DW, Beale SL (1996) The Chlorophyll biosynthetic enzyme Mg-protoporphyrin ...
  • Patade VY, Lokhande VH, Suprasanna P (2014) Exogenous application of ...
  • Teh CY, Mahmood M, Shaharuddin NA, Ho CL (2015) In ...
  • Mansour MF, Salama KH, Ali FZ, Hadid AF (2005) Cell ...
  • Akbari M, Toorchi M, Shakiba MR (2016) The effects of ...
  • Witten IH, Frank E (2005) Data mining: practical machine learning ...
  • Asadi M, Mohammadi-Nejad G, Golkar P et al. (2012) Assessment ...
  • Niazi A, Ramezani A, Dinari A (2014) GSTF1 gene expression ...
  • Liu CG, Wu YW, Hou H et al. (2002) Value ...
  • Shaik R, Ramakrishna W (2013) Machine learning approaches distinguish multiple ...
  • Furtauer L, Pschenitschnigg A, Scharkosi H et al. (2018) Combined ...
  • Flowers TJ, Colmer TD, (2008) Salinity tolerance in halophytes. New ...
  • Slama I, Abdelly C, Bouchereau A et al. (2015) Diversity, ...
  • علم سنجی و رتبه بندی مقاله

    مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
    نوع مرکز: دانشگاه دولتی
    تعداد مقالات: ۱۳۸۸۴
    در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

    مدیریت اطلاعات پژوهشی

    این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
  • کشاورزی > گندم
  • اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    مقالات مرتبط جدید

    شبکه تبلیغات علمی کشور

    به اشتراک گذاری این صفحه

    اطلاعات بیشتر درباره COI

    COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
    کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.