CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)
عنوان
مقاله

بررسی بیوانفورماتیکی توالی های EST سنبله گندم چینی بهاره تحت تنش شوری

اعتبار موردنیاز PDF: ۱ | تعداد صفحات: ۱۸ | تعداد نمایش خلاصه: ۱۶ | نظرات: ۰
سال انتشار: ۱۳۹۵
کد COI مقاله: JR_JOAGK-8-3_003
زبان مقاله: فارسی
حجم فایل: ۴۴۵.۵۸ کیلوبایت (فایل این مقاله در ۱۸ صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد)

راهنمای دانلود فایل کامل این مقاله

متن کامل این مقاله دارای ۱۸ صفحه در فرمت PDF قابل خریداری است. شما می توانید از طریق بخش روبرو فایل PDF این مقاله را با پرداخت اینترنتی ۳,۰۰۰ تومان بلافاصله دریافت فرمایید
قبل از اقدام به دریافت یا خرید مقاله، حتما به فرمت مقاله و تعداد صفحات مقاله دقت کامل را مبذول فرمایید.
علاوه بر خرید تک مقاله، می توانید با عضویت در سیویلیکا مقالات را به صورت اعتباری دریافت و ۲۰ تا ۳۰ درصد کمتر برای دریافت مقالات بپردازید. اعضای سیویلیکا می توانند صفحات تخصصی شخصی روی این مجموعه ایجاد نمایند.
برای راهنمایی کاملتر راهنمای سایت را مطالعه کنید.

خرید و دانلود فایل PDF مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای ۱۸ صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله بررسی بیوانفورماتیکی توالی های EST سنبله گندم چینی بهاره تحت تنش شوری

  زهرا زینتی - استادیار بخش اگرواکولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی داراب.
  عباس عالم زاده - دانشیار بخش زراعت واصلاح نبات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز.
  اسماعیل ابراهیمی - دانشیار پژوهشکده بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز

چکیده مقاله:

تغییرات کارکرد ژنوم تحت شرایط تنش می تواند راهکاری برای درک بهتر سازوکارهای تحمل به تنش در گیاهان باشد. در این پژوهش سعی شده است تا با بررسی توالی­های EST دو کتابخانه کنترل و تنش شوری در گندم، تغییرات کارکردی ژنوم در تنش شوری و ژن­های موثر در تحمل به شوری شناسایی شوند. بدین منظور توالی­های EST از وب­گاه هاروارد و Graingenes دریافت شدند. به منظور دسته بندی توالی­های EST، تعیین پروتئین­های مرتبط با یونی­ژن­ها (کانتیگ­ها و سینگل­تون­ها)، تعیین گروه­های کارکردی و آزمون­های آماری، به ترتیب از بانک اطلاعاتی Egassembler، بلاست وب­گاه NCBI، وب­گاه موسسه ماکس پلانک و نرم­افزار IDEG6 استفاده شد. نتایج نشان دهنده وجود اختلاف معنی­دار بین 20 گروه کارکردی در شرایط کنترل و تنش شوری بود. در هر دو شرایط کنترل و تنش شوری، گروه­های کارکردی پروتئین و RNA بیشترین و گروه­های کارکردی متابولیسم کربوهیدرات اصلی، تبدیل مواد آلی و چرخه کربس کمترین فعالیت کارکردی ژنوم را نسبت به سایر گروه­های کارکردی ژنوم به خود اختصاص دادند. تحت تنش شوری، فعالیت گروه­های کارکردی سنتز  ATP/ انتقال الکترون میتوکندریایی، متابولیسم چربی، اکسایش-کاهش، پروتئین، RNA، DNA و سلول افزایش یافت. بنابراین می توان پیشنهاد کرد که این گروه­های کارکردی دارای نقش مهمی در مکانیسم پاسخ به تنش شوری هستند. تجزیه و تحلیل بیان ژن ها در شرایط کنترل و تنش شوری نشان داد 271 ژن دارای بیان افتراقی معنی­دار بودند که در 23 گروه کارکردی مختلف قرار گرفتند. ژن­های شناسایی شده در این پژوهش می­توانند جهت دست­ورزی ژنتیکی با هدف بهبود تحمل به تنش شوری در گیاهان زراعی مورد استفاده قرار گیرند.

کلیدواژه‌ها:

تنش شوری, ژنومیکس کارکردی, سنبله

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:
https://www.civilica.com/Paper-JR_JOAGK-JR_JOAGK-8-3_003.html
کد COI مقاله: JR_JOAGK-8-3_003

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
زینتی, زهرا؛ عباس عالم زاده و اسماعیل ابراهیمی، ۱۳۹۵، بررسی بیوانفورماتیکی توالی های EST سنبله گندم چینی بهاره تحت تنش شوری، دوفصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی 8 (3)، https://www.civilica.com/Paper-JR_JOAGK-JR_JOAGK-8-3_003.html

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (زینتی, زهرا؛ عباس عالم زاده و اسماعیل ابراهیمی، ۱۳۹۵)
برای بار دوم به بعد: (زینتی؛ عالم زاده و ابراهیمی، ۱۳۹۵)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

  • Agarwal S, Grover A (2005). Isolation and transcription profiling of ...
  • Ali Q, Ahsan M, Tahir M, Elahi M, farooq J, ...
  • Apse MP, Aharon GS, Snedden WA, Blumwald E (1999). Salt ...
  • Bergeron D, Beauseigle D, Bellemare G (1993). Sequence and expression ...
  • Carpenter CD, Kreps JA, Simon AE (1994). Genes encoding glycine-rich ...
  • Caruso G, Cavaliere C, Guarino C, Gubbiotti R, Foglia P, ...
  • Chiou TJ, Aung K, Lin SI, Wu CC, Chiang SF, ...
  • Cooper B, Clarke JD, Budworth P, Kreps J, Hutchison D, ...
  • Dat J, Vandenabeele S, Vranova E, Van Montagu M, Inze ...
  • de Vitry C, Olive J, Drapier D, Recouvreur M, Wollman ...
  • Dong Q, Kroiss L, Oakley FD, Wang B, Brendel V ...
  • Dreyfuss G, Matunis MJ, Pinol-Roma S, Burd CG (1993). hnRNP ...
  • Fleury D, Jefferies S, Kuchel H, Langridge P (2010). Genetic ...
  • Forment J, Naranjo MA, Roldan M, Serrano R, Vicente O ...
  • Fujii H, Chiou TJ, Lin SI, Aung K, Zhu JK ...
  • Gao L, Yan X, Li X, Guo G, Hu Y, ...
  • Gruber M, Wu L, Links M, Gietvai B, Durkin J, ...
  • Gueguen Y, Cadoret JP, Flament D, Barreau-Roumiguiere C, Girardot AL, ...
  • Guiltinan MJ, Niu X (1996). cDNA encoding a wheat (Triticum ...
  • Heintzen C, Melzer S, Fischer R, Kappeler S, Apel K, ...
  • Higgins CF (1991). Stability and degradation of mRNA. Current Opinion ...
  • Houde M, Belcaid M, Ouellet F, Danyluk J, Monroy AF, ...
  • Jones-Rhoades, MW, Bartel DP (2004). Computational identification of plant microRNAs ...
  • Khraiwesh B, Zhu JK, Zhu J (2012). Role of miRNAs ...
  • Kore-eda S, Cushman MA, Akselrod I, Bufford D, Fredrickson M, ...
  • MasoudiNejad A, Tonomura K, Kawashima S, Moriya Y, Suzuki M, ...
  • Mehta PA, Sivaprakash K, Parani M, Venkataraman G, Parida AK ...
  • Navarro L, Dunoyer P, Jay F, Arnold B, Dharmasiri N, ...
  • Noctor G, Foyer CH (1998). Ascorbate and glutathione: Keeping active ...
  • Rhee SY, Dickerson J, Xu D (2006). Bioinformatics and its ...
  • Reymond P, Weber H, Damond M, Farmer EE (2000). Differential ...
  • Richmond T, Somerville S (2000). Chasing the dream: plant EST ...
  • Romualdi C, Bortolzuzz S, Dalessi F, Danieli GA (2003). IDEG6: ...
  • Sahi C, Singh A, Blumwald E, Grover A (2006). Beyond ...
  • Shamloo-dashtpagerdi R (2009). Analysis of EST sequences of triticum monoccocum, ...
  • Shikanai T, Takeda T, Yamauchi H, Sano S, Tomizawa KI, ...
  • Smith B, Williams J, Schulze-Kremer S (2003). The ontology of ...
  • Sunkar R, Li YF, Jagadeeswaran G (2012). Functions of microRNAs ...
  • Sunkar R, Kapoor A, Zhu JK (2006). Posttranscriptional induction of ...
  • Sunkar R, Zhu JK (2004). Novel and stress-regulated microRNAs and ...
  • Urano K, Kurihara Y, Seki M, Shinozaki K (2010). ‘Omics’ ...
  • Usadel B, Nagel A, Steinhauser D, Gibon Y, Bläsing OE, ...
  • Van Camp W, Capiau K, Van Montagu M, Inze D, ...
  • Wang Zl, Li Ph, Fredricksen M, Gong Zz, Kim CS, ...
  • Winter J, Diederichs S (2011). MicroRNA biogenesis and cancer. Methods ...
  • Zhang L, Ma XL, Zhang Q, Ma CL, Wang PP, ...
  • Zhuang J, Zhu B (2014). Analysis of Brassica napus ESTs: ...
  • Zhu JK (2000). Genetic analysis of plant salt tolerance using ...
  • Zouari N, Ben Saad R, Legavre T, Azaza J, Sabau ...
  • علم سنجی و رتبه بندی مقاله

    مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
    نوع مرکز: دانشگاه دولتی
    تعداد مقالات: ۱۳۸۰۹
    در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

    مدیریت اطلاعات پژوهشی

    این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
  • کشاورزی > گندم
  • کشاورزی > تنش شوری
  • اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    مقالات مرتبط جدید

    شبکه تبلیغات علمی کشور

    به اشتراک گذاری این صفحه

    اطلاعات بیشتر درباره COI

    COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
    کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.