شناسایی QTL های عملکرد و صفات مرتبط با عملکرد برنج با استفاده از نقشه لینکاژی با تراکم بالای نشانگرهای SNP

برنج یکی از غلات مهم با تنوع بسیار خوب است که به عنوان غذای اصلی نیمی از جمعیت جهان استفاده می­شود. مکان­یابی جایگاه­های کنترل کننده صفات کمی یکی از روش­های کاربردی و مهم برای مطالعه صفات مرتبط با عملکرد است. در این مطالعه تعداد 188 لاین (F4) برنج حاصل از تلاقی CSR28 و صدری به همراه والدین خود جهت بررسی فنوتیپی و ژنوتیپی مورد ارزیابی قرار گرفت. هدف از این مطالعه تهیه نقشه پیوستگی با درجه اشباع بالا با استفاده از نشانگرهای SNP (Infinium Illumina 6K SNP chip) و شناسایی مکان­های ژنی کنترل کننده صفات مرتبط با عملکرد در 188 لاین جمعیت F4 است. مکان­یابی جایگاه­های کنترل کننده صفات کمی منجر به شناسایی 21 QTL برای صفات مورد مطالعه بر روی کروموزوم­های 1، 2، 3، 5، 7، 8 و 10 شد. برای تعداد دانه­های پرشده در بوته یک QTL (qFG_N-3-1) روی کروموزوم 3 شناسایی شد. سه QTL (qSpkF_N-2-1، qSpkF_N-3-1 و qSpkF_N-5-1) برای درصد باروری روی کروموزوم­های 2، 3 و 5 مکان­یابی شد که 28/29 درصد از واریانس فنوتیپی را توجیه کردند. یک QTL (qGY_N-8-1) برای عملکرد دانه در فاصله نشانگری 9037125 و 9049928 روی کروموزوم 8 مکان­یابی شد. در نهایت، علاوه بر شناخت QTL­های جدید می­توان دیگر QTL­هایی که در نواحی مشابه با مطالعات قبلی شناسایی شدهرا به عنوان QTL-های دارای اعتبار معرفی کرد که مناسب برای برنامه­های اصلاحی به کمک نشانگر است.

کلیدواژه ها:

برنج ، صفات کمی ، نقشه یابی ، نشانگر SNP