A novel accurate amplification created restriction site method for determination of the wild type and the precore mutant hepatitis B virus (HBV) variants
محل انتشار: چهارمین همایش ملی بیوتکنولوژی ایران
سال انتشار: 1384
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 2,311
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI04_352
تاریخ نمایه سازی: 30 دی 1386
چکیده مقاله:
The most common occurring hepatits B virus (HBV) mutation is the G to A mutation at nucleotide 1896 in the precore region. The aim of this study is to develop a novel accurate amplification created restriction site (ACRS) method for determination of the TGG wild type and the TAG precore mutant HBV variants. Two conserved and consensus specific and diagnostic primers introducing BstX I and Xag I cleavage site were designed in order to determine the G1896 wild type and the A1896 precore mutant HBV variants in all HBV genotype.The results of ACRS method were compared with sequencing data. In the ACRS method, three different informative patterns could be distingished for determination of the wild type, the precore mutant and mixed infection HBV variants. The results of ACRS method on thirty HBV isolates revealed the TAG precore mutant in 50% (15/30), the TGG wild type variant in 30% (9/30) and the mixed infection in 20% (6/30). The sequencing data of these samples were in agreement with the ACRS results. The developed ACRS method is a rapid and cost effective technique for detection of both the TGG wild type and the TAG HBV precore mutant variants. It can be performed for follow up of G1896A precore mutant variant in hepatits B virus infected subjects at routine molecular diagostic laboratories.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
Samad Amini Bavil-Olayee
Biotechnology Department, Pasteur Institute of Iran، Tehran
Ramin Sarrami-Forooshani
Biotechnology Department, Pasteur Institute of Iran، Tehran
Ahmad Adeli
Biotechnology Department, Pasteur Institute of Iran، Tehran
Fereidoun Mahboubi
Biotechnology Department, Pasteur Institute of Iran، Tehran